101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_16030 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_16030  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  100 
 
 
108 aa  211  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.735879  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1926  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  59.62 
 
 
90 aa  71.6  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000393248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  45.88 
 
 
82 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12129  twin arginine translocase protein A  50 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119011  normal  0.626487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  47.44 
 
 
79 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  47.44 
 
 
79 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  47.44 
 
 
79 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  46.38 
 
 
84 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.44 
 
 
86 aa  60.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2183  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  58.93 
 
 
98 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00719783  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6972  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40 
 
 
82 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1503  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  52.31 
 
 
121 aa  57.4  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.432776  hitchhiker  0.000608688 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1204  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.51 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397153  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1252  twin argininte translocase protein A  57.5 
 
 
63 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3980  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.28 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368125  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4453  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  47.76 
 
 
87 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  normal  0.0943376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1882  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  56.25 
 
 
98 aa  50.4  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217317  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1780  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  49.15 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000204006  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2169  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  49.21 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.309144  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1869  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.26 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0618577  normal  0.146406 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  34.62 
 
 
73 aa  48.5  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11960  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  47.5 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00933291  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  46.15 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4869  twin arginine-targeting protein translocase  50 
 
 
98 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.115935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2468  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38.37 
 
 
89 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.134961  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  36.62 
 
 
71 aa  47  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2060  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.08 
 
 
110 aa  47  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.220179  normal  0.159543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2319  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
103 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2607  twin arginine-targeting protein translocase  50 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181166  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0593  twin arginine-targeting protein translocase  28.92 
 
 
90 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0778682  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  33.33 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3667  twin arginine-targeting protein translocase  48.78 
 
 
74 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.04 
 
 
234 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14010  Sec-independent protein secretion pathway component  39.8 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0143523  normal  0.0843722 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2252  twin arginine translocase protein A  45.76 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118258  normal  0.775201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2251  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.72 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.624721  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1290  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.89 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3893  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.94 
 
 
98 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000775372  normal  0.0335955 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03729  twin arginate translocase protein A  28.57 
 
 
89 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4143  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  28.57 
 
 
89 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4060  twin arginine translocase protein A  28.57 
 
 
89 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4357  twin arginine translocase protein A  28.57 
 
 
89 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4172  twin arginine translocase protein A  28.57 
 
 
89 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4219  twin arginine translocase protein A  28.57 
 
 
89 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000534465 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4308  twin arginine translocase protein A  28.57 
 
 
89 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5277  twin arginine translocase protein A  28.57 
 
 
89 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274389  normal  0.174664 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03678  hypothetical protein  28.57 
 
 
89 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4244  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.35 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3045  Sec-independent protein translocase protein TatA  33.33 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2652  twin arginine-targeting protein translocase  41.1 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.572667  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0292  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  29.76 
 
 
89 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328055  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4378  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48.65 
 
 
69 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.600878  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0320  twin arginine-targeting protein translocase  31.4 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3912  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  29.41 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0942  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.83 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2429  twin arginine translocase protein A  25.84 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2370  twin arginine translocase protein A  42.37 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.730984  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2999  twin arginine translocase protein A  26.97 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  30.3 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0981  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.9 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1005  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.5 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  27.91 
 
 
106 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.15 
 
 
140 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2684  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.12 
 
 
97 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.388959  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.67 
 
 
207 aa  42  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0069  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.55 
 
 
60 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  44.44 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3957  twin arginine translocase protein A  31.25 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0707519 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1318  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  28.09 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000527317 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1046  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  32.39 
 
 
59 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00953669 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001924  twin-arginine translocation protein TatA  31.17 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2436  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.92 
 
 
81 aa  41.2  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0503  twin arginine-targeting protein translocase  27.27 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0244  twin-arginine translocation protein TatA/E  36.73 
 
 
56 aa  40.8  0.006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.317121  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  46.88 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  24.21 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0472  twin arginine-targeting protein translocase  27.16 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0395  twin arginine-targeting protein translocase  33.85 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0405  twin arginine-targeting protein translocase  33.85 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.019238  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4099  twin arginine-targeting protein translocase  28.77 
 
 
78 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.966415 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4253  twin arginine translocase protein A  32.31 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4300  twin arginine translocase protein A  32.31 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111874  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4181  twin arginine translocase protein A  32.31 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4204  twin arginine translocase protein A  32.31 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4360  twin arginine translocase protein A  32.31 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.96 
 
 
88 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4849  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  42 
 
 
56 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00272525  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0744  twin arginine translocase protein A  28.21 
 
 
82 aa  40.4  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632356  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  56.25 
 
 
101 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0781  twin arginine translocase protein A  26.19 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0308647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3898  twin arginine-targeting protein translocase  25.97 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  30.77 
 
 
88 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0416  twin arginine-targeting protein translocase  25.97 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0428  twin arginine-targeting protein translocase  25.97 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000041421 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0442  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  25.97 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1725  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.51 
 
 
58 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1749  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.51 
 
 
58 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00565  twin arginine translocase protein A  39.02 
 
 
82 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18530  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  51.61 
 
 
95 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0332142  decreased coverage  0.00893017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5859  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  60.71 
 
 
107 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86878  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>