147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1290 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1290  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  100 
 
 
94 aa  188  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  48.15 
 
 
82 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  47.19 
 
 
84 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  51.43 
 
 
79 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  51.43 
 
 
79 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  51.43 
 
 
79 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12129  twin arginine translocase protein A  39.53 
 
 
115 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119011  normal  0.626487 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1204  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  42.25 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397153  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.25 
 
 
86 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18530  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  71.43 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0332142  decreased coverage  0.00893017 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3980  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.86 
 
 
103 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368125  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1780  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  57.81 
 
 
67 aa  60.5  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000204006  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2607  twin arginine-targeting protein translocase  54.9 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181166  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  42.11 
 
 
71 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4869  twin arginine-targeting protein translocase  56.86 
 
 
98 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.115935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2251  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  58.82 
 
 
114 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.624721  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1503  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  55.56 
 
 
121 aa  57  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.432776  hitchhiker  0.000608688 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0069  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  57.69 
 
 
60 aa  57  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6972  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.08 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  38.36 
 
 
81 aa  54.7  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  33.33 
 
 
73 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3667  twin arginine-targeting protein translocase  54.76 
 
 
74 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1869  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  57.45 
 
 
85 aa  53.9  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0618577  normal  0.146406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3893  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.07 
 
 
98 aa  53.5  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000775372  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1926  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.77 
 
 
90 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000393248 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21960  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  40 
 
 
107 aa  51.2  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148281  normal  0.304965 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  52.5 
 
 
92 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1252  twin argininte translocase protein A  50 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0016  twin arginine-targeting protein translocase  32.56 
 
 
85 aa  50.4  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1769  twin-arginine translocation protein TatA/E  48.08 
 
 
101 aa  50.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506415  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2319  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.66 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0744  twin arginine translocase protein A  35.48 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632356  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0781  twin arginine translocase protein A  35.48 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0308647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4378  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  52.78 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.600878  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2468  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.18 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.134961  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4417  twin arginine translocase protein A  35.44 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2060  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.32 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.220179  normal  0.159543 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0395  twin arginine-targeting protein translocase  37.1 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0405  twin arginine-targeting protein translocase  37.1 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.019238  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2305  twin arginine translocase protein A  64.52 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0188826  normal  0.0162961 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2790  twin arginine translocase protein A  38.36 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0371592  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2183  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  58.33 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00719783  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4453  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.31 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  normal  0.0943376 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1310  twin arginine-targeting protein translocase  45.16 
 
 
79 aa  47.4  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1191  twin arginine-targeting protein translocase  45.16 
 
 
79 aa  47.4  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0553  twin arginine-targeting protein translocase  45.16 
 
 
79 aa  47.4  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.459235  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2370  twin arginine translocase protein A  59.18 
 
 
100 aa  47.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.730984  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1053  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 
87 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1882  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  58.06 
 
 
98 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217317  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  56.1 
 
 
61 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  56.1 
 
 
61 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  56.1 
 
 
61 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  56.1 
 
 
61 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  56.1 
 
 
61 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0814  twin arginine translocase protein A  32.39 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514575  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1515  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.55 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00781786  normal  0.224045 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  56.1 
 
 
61 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3219  twin arginine translocase protein A  32.26 
 
 
85 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.497525  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2872  twin arginine translocase protein A  32.26 
 
 
85 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0548189 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  56.1 
 
 
61 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  56.1 
 
 
61 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  56.1 
 
 
61 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1779  twin arginine translocase protein A  32.1 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00352153  hitchhiker  0.00879203 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0706  twin arginine translocase protein A  29.63 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.121051  normal  0.444547 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2689  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  59.38 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2252  twin arginine translocase protein A  57.14 
 
 
100 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118258  normal  0.775201 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  48.98 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5554  twin arginine translocase protein A  44.68 
 
 
79 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.80239  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0339  twin arginine translocase protein A  39.06 
 
 
76 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11873  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  53.66 
 
 
59 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0412  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.03 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3375  twin arginine translocase protein A  35.71 
 
 
76 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1788  twin arginine translocase protein A  37.7 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16030  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  48.89 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.735879  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3189  twin arginine translocase protein A  35 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681948  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1180  twin arginine translocase protein A  44.19 
 
 
82 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2684  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.5 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.388959  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2942  twin arginine translocase protein A  38.1 
 
 
85 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2745  twin arginine translocase protein A  30.23 
 
 
79 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.254475  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3100  twin arginine translocase protein A  38.3 
 
 
73 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  37.88 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2513  twin arginine translocase protein A  36.49 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.640298  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1823  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.61 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2485  twin arginine translocase protein A  30.12 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.359725  normal  0.0181942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3590  twin arginine translocase protein A  38.46 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.744358  normal  0.70676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3708  twin arginine translocase protein A  36 
 
 
95 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0454657  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0354  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2436  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  58.82 
 
 
81 aa  44.3  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0363  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  42.59 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  52.94 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0409  twin arginine translocase protein A  36.84 
 
 
79 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3399  twin arginine translocase protein A  36 
 
 
95 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3237  twin arginine translocase protein A  37.25 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0415  twin arginine translocase protein A  38.33 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00507108 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0115  twin arginine translocase protein A  33.93 
 
 
73 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2748  twin arginine translocase protein A  44.74 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665647  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  28.05 
 
 
87 aa  42.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3549  twin arginine translocase protein A  32.43 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0475634  hitchhiker  0.000865371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3836  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.22 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.647162 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>