225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_4143 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03729  twin arginate translocase protein A  100 
 
 		 89 aa  176  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4143  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  100 
 
 		 89 aa  176  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4357  twin arginine translocase protein A  100 
 
 		 89 aa  176  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4060  twin arginine translocase protein A  100 
 
 		 89 aa  176  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03678  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  176  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4219  twin arginine translocase protein A  100 
 
 		 89 aa  176  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000534465 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4308  twin arginine translocase protein A  100 
 
 		 89 aa  176  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5277  twin arginine translocase protein A  100 
 
 		 89 aa  176  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274389  normal  0.174664 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4172  twin arginine translocase protein A  100 
 
 		 89 aa  176  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3957  twin arginine translocase protein A  85.39 
 
 		 84 aa  144  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0707519 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4360  twin arginine translocase protein A  84.27 
 
 		 84 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4300  twin arginine translocase protein A  84.27 
 
 		 84 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4181  twin arginine translocase protein A  84.27 
 
 		 84 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4204  twin arginine translocase protein A  84.27 
 
 		 84 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4253  twin arginine translocase protein A  84.27 
 
 		 84 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4244  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  63.74 
 
 		 86 aa  108  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3760  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  59.34 
 
 		 85 aa  103  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3912  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  60 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0251  twin arginine-targeting protein translocase  61.7 
 
 		 87 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.293668 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2999  twin arginine translocase protein A  59.09 
 
 		 82 aa  99.8  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2429  twin arginine translocase protein A  61.11 
 
 		 82 aa  98.6  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3942  twin arginine-targeting protein translocase  65.22 
 
 		 88 aa  97.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3638  Sec-independent protein translocase protein TatA  65.22 
 
 		 88 aa  97.8  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0274  twin arginine-targeting protein translocase TatA  65.22 
 
 		 88 aa  97.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001924  twin-arginine translocation protein TatA  61.11 
 
 		 81 aa  97.1  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00565  twin arginine translocase protein A  61.11 
 
 		 82 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0416  twin arginine-targeting protein translocase  58.23 
 
 		 79 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3728  twin arginine-targeting protein translocase  59.09 
 
 		 85 aa  88.6  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0442  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  58.23 
 
 		 79 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3898  twin arginine-targeting protein translocase  58.23 
 
 		 79 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0428  twin arginine-targeting protein translocase  58.23 
 
 		 79 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000041421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0503  twin arginine-targeting protein translocase  59.49 
 
 		 79 aa  89  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3554  twin arginine-targeting protein translocase  57.95 
 
 		 85 aa  87  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0402  twin arginine-targeting protein translocase  57.95 
 
 		 85 aa  87  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4099  twin arginine-targeting protein translocase  56.18 
 
 		 78 aa  86.3  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.966415 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3376  twin arginine-targeting protein translocase  59.21 
 
 		 76 aa  85.9  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0852423  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4202  Sec-independent protein translocase protein TatA  54.84 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4053  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  61.54 
 
 		 86 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3795  twin arginine-targeting protein translocase  57.83 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743518  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3045  Sec-independent protein translocase protein TatA  55.17 
 
 		 79 aa  83.6  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3205  Sec-independent protein translocase protein TatA  81.63 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0320  twin arginine-targeting protein translocase  54.65 
 
 		 88 aa  80.9  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0472  twin arginine-targeting protein translocase  55.41 
 
 		 81 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0524  twin arginine-targeting protein translocase  50.56 
 
 		 83 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.897575 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2971  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  62.5 
 
 		 69 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00309368  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3420  twin arginine-targeting protein translocase  74.47 
 
 		 75 aa  75.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.984089  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1038  twin arginine-targeting protein translocase  48.65 
 
 		 77 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0593  twin arginine-targeting protein translocase  51.28 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0778682  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1972  twin arginine-targeting protein translocase  67.35 
 
 		 86 aa  73.2  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113539  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1174  twin arginine translocase protein A  58.73 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000428272  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4185  twin arginine-targeting protein translocase  45.95 
 
 		 77 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3157  twin arginine translocase protein A  57.14 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000988339  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2982  twin arginine translocase protein A  46.75 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1194  twin arginine translocase protein A  50.72 
 
 		 69 aa  67.4  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1082  twin arginine-targeting protein translocase  41.67 
 
 		 77 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1041  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.67 
 
 		 77 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0115  twin arginine translocase protein A  45.21 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2703  twin arginine translocase protein A  56.86 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3682  twin arginine translocase protein A  56.86 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.759225  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3534  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36939  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0363  twin arginine translocase protein A  56.86 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0415  twin arginine translocase protein A  56.86 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00507108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2671  twin arginine translocase protein A  56.86 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0354  twin arginine translocase protein A  56.86 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0436  twin arginine translocase protein A  56.86 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.510795  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3250  twin arginine translocase protein A  56.86 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1799  twin arginine translocase protein A  56.86 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3655  twin arginine translocase protein A  56.86 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3713  twin arginine translocase protein A  56.86 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2754  twin arginine translocase protein A  56.86 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0116  twin arginine translocase protein A  45.21 
 
 		 73 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0466  tatA protein  39.29 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.50733e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0339  twin arginine translocase protein A  56.86 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2748  twin arginine translocase protein A  61.7 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2956  twin arginine translocase protein A  44.29 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441346  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3028  twin arginine translocase protein A  44.29 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368135  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1053  twin arginine translocase protein A  47.13 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1856  twin arginine translocase protein A  44.29 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000816668  normal  0.827039 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0163  Sec-independent protein translocase protein TatA  50.56 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0706  twin arginine translocase protein A  45.95 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.121051  normal  0.444547 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0781  twin arginine translocase protein A  52.63 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0308647 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0744  twin arginine translocase protein A  52.63 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632356  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3219  twin arginine translocase protein A  41.86 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.497525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2872  twin arginine translocase protein A  49.18 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0548189 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3100  twin arginine translocase protein A  48.57 
 
 		 73 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0409  twin arginine translocase protein A  50.91 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2942  twin arginine translocase protein A  54.9 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3375  twin arginine translocase protein A  51.67 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3237  twin arginine translocase protein A  58.82 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5554  twin arginine translocase protein A  48.53 
 
 		 79 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.80239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0814  twin arginine translocase protein A  60 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3549  twin arginine translocase protein A  57.14 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0475634  hitchhiker  0.000865371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1180  twin arginine translocase protein A  57.78 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0458  twin arginine-targeting protein translocase  52.22 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00560  twin argininte translocase protein A  67.74 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0258  twin arginine translocase protein A  53.33 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0612508  hitchhiker  0.00415205 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3058  twin-arginine translocation protein TatA/E  50.62 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1704  twin arginine translocase protein A  50 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1162  twin arginine translocase protein E  57.35 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.47 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>