205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0195 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  100 
 
 
86 aa  177  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  61.22 
 
 
79 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  61.22 
 
 
79 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  61.22 
 
 
79 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  56.86 
 
 
82 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  58 
 
 
84 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6972  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.14 
 
 
82 aa  73.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12129  twin arginine translocase protein A  60.78 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119011  normal  0.626487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3980  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.48 
 
 
103 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368125  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2468  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.44 
 
 
89 aa  60.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.134961  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1926  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.45 
 
 
90 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000393248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2370  twin arginine translocase protein A  49.23 
 
 
100 aa  60.1  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.730984  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2252  twin arginine translocase protein A  51.72 
 
 
100 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118258  normal  0.775201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3667  twin arginine-targeting protein translocase  56.82 
 
 
74 aa  58.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1252  twin argininte translocase protein A  48.84 
 
 
63 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1780  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  68.89 
 
 
67 aa  57  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000204006  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2607  twin arginine-targeting protein translocase  56.82 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181166  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18530  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  44.74 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0332142  decreased coverage  0.00893017 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4453  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  54.39 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  normal  0.0943376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4869  twin arginine-targeting protein translocase  56.82 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.115935 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2319  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.06 
 
 
103 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3893  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.81 
 
 
98 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000775372  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21960  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  59.09 
 
 
107 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148281  normal  0.304965 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  35 
 
 
73 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  41.18 
 
 
81 aa  53.9  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  42.11 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1503  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.1 
 
 
121 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.432776  hitchhiker  0.000608688 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  41.79 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  43.18 
 
 
71 aa  51.6  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2251  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.98 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.624721  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  45.24 
 
 
92 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2183  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  46.43 
 
 
98 aa  50.8  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00719783  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0069  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.77 
 
 
60 aa  50.8  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4378  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.24 
 
 
69 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.600878  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1290  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.25 
 
 
94 aa  50.4  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1779  twin arginine translocase protein A  40.38 
 
 
78 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00352153  hitchhiker  0.00879203 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.91 
 
 
92 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3708  twin arginine translocase protein A  31.46 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0454657  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1788  twin arginine translocase protein A  40.38 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0981  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.43 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  38.18 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0524  twin arginine-targeting protein translocase  34.29 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.897575 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3189  twin arginine translocase protein A  40.38 
 
 
78 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681948  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2745  twin arginine translocase protein A  40.38 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.254475  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  66.67 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4417  twin arginine translocase protein A  42.31 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.99 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0244  twin-arginine translocation protein TatA/E  36.73 
 
 
56 aa  48.5  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.317121  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2790  twin arginine translocase protein A  40.38 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0371592  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0116  twin arginine translocase protein A  32.08 
 
 
73 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.59 
 
 
90 aa  48.9  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2872  twin arginine translocase protein A  27.69 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0548189 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1204  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  52.63 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397153  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3399  twin arginine translocase protein A  30.34 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3219  twin arginine translocase protein A  27.69 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.497525  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1882  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.18 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217317  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.54 
 
 
74 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2703  twin arginine translocase protein A  36.17 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3682  twin arginine translocase protein A  36.17 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.759225  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3237  twin arginine translocase protein A  31.82 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3250  twin arginine translocase protein A  36.17 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1799  twin arginine translocase protein A  36.17 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3655  twin arginine translocase protein A  36.17 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3713  twin arginine translocase protein A  36.17 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2754  twin arginine translocase protein A  36.17 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  47.62 
 
 
130 aa  47.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  31.75 
 
 
91 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2982  twin arginine translocase protein A  36.17 
 
 
77 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  31.75 
 
 
91 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2513  twin arginine translocase protein A  40.38 
 
 
78 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.640298  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  36.21 
 
 
90 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2060  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.86 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.220179  normal  0.159543 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3375  twin arginine translocase protein A  34.04 
 
 
76 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3100  twin arginine translocase protein A  31.75 
 
 
73 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  43.75 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3534  twin arginine translocase protein A  34.04 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36939  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  37.04 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0292  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  30.77 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328055  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0814  twin arginine translocase protein A  28.92 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514575  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2671  twin arginine translocase protein A  34.04 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4185  twin arginine-targeting protein translocase  30.36 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0354  twin arginine translocase protein A  34.04 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0436  twin arginine translocase protein A  34.04 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.510795  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0415  twin arginine translocase protein A  34.04 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00507108 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0706  twin arginine translocase protein A  28.92 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.121051  normal  0.444547 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0115  twin arginine translocase protein A  32.08 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0363  twin arginine translocase protein A  34.04 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3795  twin arginine-targeting protein translocase  35.29 
 
 
89 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743518  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4143  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  31.03 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1038  twin arginine-targeting protein translocase  34.88 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1041  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.88 
 
 
77 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03678  hypothetical protein  31.03 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1749  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40 
 
 
58 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4172  twin arginine translocase protein A  31.03 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  36.11 
 
 
91 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4219  twin arginine translocase protein A  31.03 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000534465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2323  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.82 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.405896  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1082  twin arginine-targeting protein translocase  34.88 
 
 
77 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1725  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40 
 
 
58 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4060  twin arginine translocase protein A  31.03 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>