120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2323 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2323  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  100 
 
 
63 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.405896  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4498  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  75.41 
 
 
67 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1459  sec-independent protein translocase  56.9 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0926084  normal  0.0392107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4461  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.46 
 
 
66 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.408951 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.46 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3836  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  60 
 
 
67 aa  58.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.647162 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1332  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.33 
 
 
77 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0024  sec-independent protein translocase  75.76 
 
 
71 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0534  Sec-independent protein translocase TatA  50.98 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  43.55 
 
 
81 aa  54.7  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  43.33 
 
 
136 aa  53.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1005  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.83 
 
 
77 aa  53.5  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0981  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.15 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  39.58 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.06 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0596  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  60 
 
 
69 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0621767 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  45.1 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1023  twin arginine-targeting protein translocase  55.81 
 
 
59 aa  50.8  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07460  Twin-arginine translocation protein TatA/E  42.55 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0539  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  57.69 
 
 
70 aa  50.8  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.74 
 
 
69 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.75 
 
 
106 aa  50.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1748  twin-arginine translocation protein TatA/E  54.72 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  50 
 
 
73 aa  50.1  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0702  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  59.57 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0624  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  65.12 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.479059  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.86 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1611  twin-arginine translocation protein TatA/E  60 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0577  twin arginine-targeting protein translocase  55.32 
 
 
65 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1677  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  42 
 
 
84 aa  48.9  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  41.51 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  57.89 
 
 
71 aa  48.1  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2500  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0231  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  64.71 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.74798e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.58 
 
 
113 aa  47.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  38.78 
 
 
101 aa  47  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1088  Sec-independent protein translocase, MttA/Hcf106 family  68.42 
 
 
79 aa  47  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.502554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  42.55 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2379  twin arginine-targeting protein translocase  50.98 
 
 
55 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329124  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1252  twin argininte translocase protein A  47.83 
 
 
63 aa  46.2  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0773  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0133448 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 
59 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.06 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.55 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  51.28 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  42.55 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0917  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.31 
 
 
62 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0191  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.76 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0104423  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.82 
 
 
86 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1969  twin arginine-targeting protein translocase  65.12 
 
 
92 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.24 
 
 
92 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  45.24 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1003  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  47.22 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  38.46 
 
 
91 aa  44.7  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.18 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.18 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  45.24 
 
 
91 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.18 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  45.24 
 
 
91 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.82 
 
 
94 aa  44.3  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  43.18 
 
 
67 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1278  Sec-independent protein translocase TatA  48 
 
 
73 aa  44.3  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0109777  hitchhiker  0.00000252177 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.78 
 
 
90 aa  43.9  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2607  twin arginine-targeting protein translocase  41.3 
 
 
107 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181166  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0244  twin-arginine translocation protein TatA/E  43.4 
 
 
56 aa  43.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.317121  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  40.91 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1063  Sec-independent protein translocase TatA  46.81 
 
 
60 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0562008 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4869  twin arginine-targeting protein translocase  43.18 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.115935 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0190  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.65 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000115386  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3518  twin arginine translocase protein A  61.29 
 
 
108 aa  42.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000524898  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1310  twin arginine-targeting protein translocase  73.08 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2436  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  45.24 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1191  twin arginine-targeting protein translocase  73.08 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0553  twin arginine-targeting protein translocase  73.08 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.459235  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0941  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.67 
 
 
55 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.5 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3587  twin arginine translocase protein A  58.06 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38.1 
 
 
79 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3667  twin arginine-targeting protein translocase  43.24 
 
 
74 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3682  twin arginine-targeting protein translocase  40.38 
 
 
60 aa  41.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000036766  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  40.38 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3384  twin arginine translocase protein A  45.28 
 
 
56 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0395  twin arginine-targeting protein translocase  33.33 
 
 
71 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0405  twin arginine-targeting protein translocase  33.33 
 
 
71 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.019238  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4596  twin arginine-targeting protein translocase  51.02 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.341736  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2251  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.22 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.624721  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1225  Sec-independent protein translocase TatA  46.81 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100746 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>