56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2183 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2183  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  100 
 
 
98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00719783  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1926  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  76.29 
 
 
90 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000393248 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14010  Sec-independent protein secretion pathway component  62.07 
 
 
125 aa  67  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0143523  normal  0.0843722 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  48.48 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  48.48 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  48.48 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.43 
 
 
86 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  46.67 
 
 
84 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11960  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  53.25 
 
 
85 aa  60.8  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00933291  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12129  twin arginine translocase protein A  47.62 
 
 
115 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119011  normal  0.626487 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1882  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  56.14 
 
 
98 aa  60.5  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217317  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  63.04 
 
 
82 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1503  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50.88 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.432776  hitchhiker  0.000608688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4453  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  47.76 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  normal  0.0943376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6972  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.82 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16030  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  58.93 
 
 
108 aa  52  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.735879  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3980  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.49 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368125  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2468  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.92 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.134961  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4869  twin arginine-targeting protein translocase  48.89 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.115935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2607  twin arginine-targeting protein translocase  48.89 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181166  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1204  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.83 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397153  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1252  twin argininte translocase protein A  44.68 
 
 
63 aa  47.8  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2319  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.22 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1869  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.85 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0618577  normal  0.146406 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0981  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.66 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2251  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.22 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.624721  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2060  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.06 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.220179  normal  0.159543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2169  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.16 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.309144  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1780  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.28 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000204006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3667  twin arginine-targeting protein translocase  48.78 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  36.36 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  30 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2252  twin arginine translocase protein A  50 
 
 
100 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118258  normal  0.775201 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1005  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  34.25 
 
 
77 aa  44.3  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21960  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  40 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148281  normal  0.304965 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  31.11 
 
 
104 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  37.74 
 
 
91 aa  43.5  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  37.74 
 
 
91 aa  43.5  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2370  twin arginine translocase protein A  49.06 
 
 
100 aa  43.5  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.730984  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0244  twin-arginine translocation protein TatA/E  41.86 
 
 
56 aa  43.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.317121  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  35.29 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  35.19 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1290  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.55 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4378  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.6 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.600878  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  37.5 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0069  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.25 
 
 
60 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0190  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.22 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000115386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  31.82 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1515  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.3 
 
 
95 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00781786  normal  0.224045 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1819  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.9 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3893  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.51 
 
 
98 aa  41.6  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000775372  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2689  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48.98 
 
 
108 aa  41.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07460  Twin-arginine translocation protein TatA/E  38.98 
 
 
92 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  41.07 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  53.12 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  32.14 
 
 
115 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>