74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1819 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1819  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  100 
 
 
70 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  54.76 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  51.28 
 
 
110 aa  50.8  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  57.89 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  46.81 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0981  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38.3 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  31.43 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2684  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.47 
 
 
97 aa  47.8  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.388959  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0395  twin arginine-targeting protein translocase  42.11 
 
 
71 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0405  twin arginine-targeting protein translocase  42.11 
 
 
71 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.019238  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3836  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.647162 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1079  twin arginine-targeting protein translocase  38.46 
 
 
102 aa  47  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000000000641532  normal  0.697921 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.84 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  45.24 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  55.26 
 
 
113 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  46.34 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0781  twin arginine-targeting protein translocase  38.64 
 
 
59 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.43 
 
 
86 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0942  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.37 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2436  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.43 
 
 
81 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  42 
 
 
103 aa  45.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  32.81 
 
 
92 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  42 
 
 
111 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
92 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0152  mttA/Hcf106 family protein  37.25 
 
 
55 aa  44.7  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.33 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  47.62 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2641  twin arginine translocase protein A  40 
 
 
57 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03820  twin-arginine translocation protein, TatA subunit  42.86 
 
 
60 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1063  Sec-independent protein translocase TatA  36.96 
 
 
60 aa  44.3  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0562008 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  42.11 
 
 
88 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3237  twin arginine translocase protein A  37.25 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  44 
 
 
155 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.74 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.95 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0534  Sec-independent protein translocase TatA  47.17 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.74 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0773  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.74 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0133448 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.37 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1926  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000393248 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  47.37 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  44.74 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  44.19 
 
 
207 aa  42.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.35 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0974  Sec-independent protein translocase TatA  51.28 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.450939  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.86 
 
 
99 aa  42  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2132  twin arginine translocase protein A  39.47 
 
 
66 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  36 
 
 
84 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0787  twin arginine-targeting protein translocase  39.47 
 
 
57 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.423704  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  38.67 
 
 
90 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2724  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  57.14 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2319  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.44 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.19 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2872  twin arginine translocase protein A  30.51 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0548189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3219  twin arginine translocase protein A  30.51 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.497525  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  37.29 
 
 
82 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4378  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.21 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.600878  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  38.6 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  38.6 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  38.6 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  44.74 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.48 
 
 
152 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0814  twin arginine translocase protein A  27.27 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514575  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1807  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.74 
 
 
193 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.988739  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2259  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38.1 
 
 
62 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000334335  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0363  twin arginine translocase protein A  30.43 
 
 
76 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3100  twin arginine translocase protein A  29.82 
 
 
73 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3547  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.48 
 
 
64 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00015351  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0354  twin arginine translocase protein A  30.43 
 
 
76 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  36.21 
 
 
96 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3375  twin arginine translocase protein A  35.29 
 
 
76 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2560  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.91 
 
 
68 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.835870000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>