62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1079 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1079  twin arginine-targeting protein translocase  100 
 
 
102 aa  201  3e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000000000641532  normal  0.697921 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1462  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.47 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0793  Sec-independent protein translocase TatA  40.74 
 
 
96 aa  66.2  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.331041  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.42 
 
 
91 aa  65.5  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0173138  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  40.74 
 
 
101 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0773  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  53.7 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0133448 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2436  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.17 
 
 
81 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0988  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
94 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  50.94 
 
 
130 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  38.57 
 
 
71 aa  47.8  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2705  twin arginine translocase protein A  33.8 
 
 
81 aa  47  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  27.37 
 
 
136 aa  47  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.57 
 
 
79 aa  46.2  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0534  Sec-independent protein translocase TatA  34.41 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1318  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000527317 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0942  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.89 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0577  twin arginine-targeting protein translocase  44.44 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1677  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.68 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  48.65 
 
 
73 aa  43.9  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  41.07 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0974  Sec-independent protein translocase TatA  32.08 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.450939  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0981  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.29 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0589  twin arginine translocase protein A  43.18 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.905934 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0702  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.9 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0624  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.35 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.479059  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2684  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.14 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.388959  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2790  twin arginine translocase protein A  51.28 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0371592  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2745  twin arginine translocase protein A  51.28 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.254475  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4461  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.408951 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0266  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.38 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3189  twin arginine translocase protein A  51.28 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681948  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.35 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  29.87 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  30 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  39.66 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  39.66 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4417  twin arginine translocase protein A  50 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  39.66 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0539  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.58 
 
 
70 aa  41.6  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1819  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
70 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  36.21 
 
 
82 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12129  twin arginine translocase protein A  41.51 
 
 
115 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119011  normal  0.626487 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  38.46 
 
 
122 aa  41.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1779  twin arginine translocase protein A  42.22 
 
 
78 aa  41.6  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00352153  hitchhiker  0.00879203 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3219  twin arginine translocase protein A  27.16 
 
 
85 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.497525  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  36.54 
 
 
110 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1788  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 
79 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0794  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.329034  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2724  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  31.08 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  28.24 
 
 
214 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3836  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.94 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.647162 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2872  twin arginine translocase protein A  27.16 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0548189 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3708  twin arginine translocase protein A  26.32 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0454657  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.62 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3399  twin arginine translocase protein A  26.32 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.06 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3590  twin arginine translocase protein A  38.89 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.744358  normal  0.70676 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2982  twin arginine translocase protein A  32.47 
 
 
77 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  43.18 
 
 
87 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3237  twin arginine translocase protein A  34.57 
 
 
77 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2513  twin arginine translocase protein A  48.72 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.640298  normal  0.431114 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>