73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2641 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2641  twin arginine translocase protein A  100 
 
 
57 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0405  twin arginine-targeting protein translocase  41.67 
 
 
71 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.019238  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0395  twin arginine-targeting protein translocase  41.67 
 
 
71 aa  51.2  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2132  twin arginine translocase protein A  46.81 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  44.68 
 
 
214 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0166  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.86 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.32799  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0974  Sec-independent protein translocase TatA  43.64 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.450939  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.74 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0292  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  51.35 
 
 
89 aa  46.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328055  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  59.38 
 
 
90 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  46.51 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0781  twin arginine-targeting protein translocase  43.18 
 
 
59 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.18 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.5 
 
 
92 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1063  Sec-independent protein translocase TatA  43.75 
 
 
60 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0562008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2379  twin arginine-targeting protein translocase  49.12 
 
 
55 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329124  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  50 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  44.23 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  37.29 
 
 
91 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  50 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  52.63 
 
 
76 aa  45.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  54.05 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0787  twin arginine-targeting protein translocase  43.48 
 
 
57 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.423704  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.58 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  50 
 
 
95 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  52.5 
 
 
91 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  52.63 
 
 
91 aa  44.3  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  52.5 
 
 
91 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0534  Sec-independent protein translocase TatA  41.18 
 
 
100 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1948  twin arginine-targeting protein translocase  41.67 
 
 
55 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.81 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.62 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1819  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.51 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  45.1 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1020  Sec-independent protein translocase protein tatA, putative  40 
 
 
62 aa  43.5  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0113174  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  50 
 
 
104 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  47.73 
 
 
207 aa  43.5  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03820  twin-arginine translocation protein, TatA subunit  33.33 
 
 
60 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  60.61 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  45.95 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1987  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283995  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3547  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.62 
 
 
64 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00015351  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  39.13 
 
 
87 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  44.74 
 
 
89 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  47.37 
 
 
155 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1290  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.24 
 
 
57 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1344  twin-arginine translocation protein  55.26 
 
 
155 aa  41.2  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.108227 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1725  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.25 
 
 
58 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1749  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.25 
 
 
58 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0231  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.96 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.74798e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  53.12 
 
 
128 aa  40.8  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3134  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.5 
 
 
55 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  57.58 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02761  Sec-independent protein secretion pathway component  41.51 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.226319  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.65 
 
 
96 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1310  twin arginine-targeting protein translocase  33.93 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1128  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.42 
 
 
55 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  44.74 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1617  twin-arginine translocation protein TatA/E  40 
 
 
71 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.65 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0553  twin arginine-targeting protein translocase  33.93 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.459235  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.65 
 
 
96 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1112  twin arginine-targeting protein translocase  43.4 
 
 
81 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03291  hypothetical protein  40 
 
 
71 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58964  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1191  twin arginine-targeting protein translocase  33.93 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2259  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38.1 
 
 
62 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000334335  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  52.5 
 
 
122 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.71 
 
 
88 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  54.55 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  54.55 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  45.95 
 
 
179 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0876  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.36 
 
 
43 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.697469  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.65 
 
 
96 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>