102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1112 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1112  twin arginine-targeting protein translocase  100 
 
 
81 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  50.79 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0395  twin arginine-targeting protein translocase  45.71 
 
 
71 aa  61.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0405  twin arginine-targeting protein translocase  45.71 
 
 
71 aa  61.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.019238  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  53.45 
 
 
84 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0166  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  63.49 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.32799  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  56.52 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0231  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.86 
 
 
81 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.74798e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  48.44 
 
 
61 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  48.44 
 
 
61 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  48.44 
 
 
61 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  48.44 
 
 
61 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  48.44 
 
 
61 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  48.44 
 
 
61 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  48.44 
 
 
61 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  48.44 
 
 
61 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  48.44 
 
 
61 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1103  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.97 
 
 
80 aa  57  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2560  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.62 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.835870000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03820  twin-arginine translocation protein, TatA subunit  45.76 
 
 
60 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  50 
 
 
59 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2641  twin arginine translocase protein A  43.4 
 
 
57 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3547  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.66 
 
 
64 aa  50.4  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00015351  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1896  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.07 
 
 
87 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431023  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  38.81 
 
 
103 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1117  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48.84 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.33 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0534  Sec-independent protein translocase TatA  42.11 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.9 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  47.92 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1933  twin arginine translocase protein A  48.89 
 
 
55 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00450459  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0781  twin arginine-targeting protein translocase  40.82 
 
 
59 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  46.94 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  44.9 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  37.14 
 
 
111 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  44.9 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  44.9 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.24 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.37 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2352  twin arginine translocase protein A  48.84 
 
 
56 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.33 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.58 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0191  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.67 
 
 
62 aa  47.4  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0104423  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  45.83 
 
 
91 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  45.83 
 
 
91 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
79 aa  47.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1063  Sec-independent protein translocase TatA  34.62 
 
 
60 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0562008 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1119  twin arginine-targeting protein translocase  47.73 
 
 
83 aa  47  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  48.72 
 
 
130 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  46.94 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  42.37 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0941  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
55 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2132  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 
66 aa  45.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.74 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  35.94 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.84 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0190  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.34 
 
 
63 aa  46.2  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000115386  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  42.5 
 
 
214 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0917  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.86 
 
 
62 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  44.74 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1278  Sec-independent protein translocase TatA  43.48 
 
 
73 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0109777  hitchhiker  0.00000252177 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.43 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3345  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.55 
 
 
62 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  5.61325e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0876  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.48 
 
 
43 aa  44.3  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.697469  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1987  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40 
 
 
71 aa  44.3  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283995  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1725  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.84 
 
 
58 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1749  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.84 
 
 
58 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0981  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.93 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  44.44 
 
 
207 aa  43.5  0.0009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1600  twin-arginine translocation protein TatB, putative  47.22 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0401964  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  38.33 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  46.34 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1290  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.38 
 
 
57 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.33 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  43.59 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  47.73 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1020  Sec-independent protein translocase protein tatA, putative  35.85 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0113174  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  44.44 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3384  twin arginine translocase protein A  34.88 
 
 
56 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.59 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1819  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.5 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6972  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.73 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1346  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  44.44 
 
 
96 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1482  sec-independent protein translocase TatB  44.44 
 
 
95 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.338937  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  39.58 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1807  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  44.74 
 
 
193 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.988739  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0292  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  31.88 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328055  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1230  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  62.5 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.892691  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  39.58 
 
 
76 aa  40.8  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  44.44 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45.95 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0787  twin arginine-targeting protein translocase  31.71 
 
 
57 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.423704  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0244  twin-arginine translocation protein TatA/E  31.67 
 
 
56 aa  40.4  0.008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.317121  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0045  twin arginine translocase protein A  43.9 
 
 
61 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.895264  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3682  twin arginine-targeting protein translocase  41.67 
 
 
60 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000036766  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02761  Sec-independent protein secretion pathway component  36.73 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.226319  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2323  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.96 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.405896  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  45.95 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>