31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0773 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0773  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  100 
 
 
68 aa  129  9e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0133448 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1079  twin arginine-targeting protein translocase  53.7 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000000000641532  normal  0.697921 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  51.02 
 
 
101 aa  52.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2436  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.07 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0942  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.07 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  48.08 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2684  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.78 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.388959  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1318  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.35 
 
 
115 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000527317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2323  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.405896  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52 
 
 
99 aa  45.1  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1462  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.27 
 
 
112 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1819  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.74 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  36.84 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0534  Sec-independent protein translocase TatA  36.84 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.73 
 
 
113 aa  42  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3836  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46 
 
 
67 aa  42  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.647162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  44.9 
 
 
79 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  44.9 
 
 
79 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  44.9 
 
 
79 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.99 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  67.74 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.54 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  58.06 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1459  sec-independent protein translocase  42.19 
 
 
65 aa  40.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0926084  normal  0.0392107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  58.06 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0793  Sec-independent protein translocase TatA  39.02 
 
 
96 aa  40.4  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.331041  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0988  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0266  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.43 
 
 
93 aa  40  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  43.1 
 
 
104 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1020  Sec-independent protein translocase protein tatA, putative  38.46 
 
 
62 aa  40  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0113174  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.86 
 
 
106 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>