51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1462 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1462  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  100 
 
 
112 aa  225  2e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0793  Sec-independent protein translocase TatA  64.77 
 
 
96 aa  98.2  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.331041  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1079  twin arginine-targeting protein translocase  47.47 
 
 
102 aa  94.4  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000000000641532  normal  0.697921 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  58.7 
 
 
91 aa  94  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0173138  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0773  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  47.92 
 
 
68 aa  58.2  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0133448 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2436  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.1 
 
 
81 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0942  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.06 
 
 
98 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  48.94 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0988  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  65.79 
 
 
94 aa  54.3  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  43.64 
 
 
101 aa  53.9  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2684  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  57.14 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.388959  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0266  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  58.33 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12129  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119011  normal  0.626487 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0974  Sec-independent protein translocase TatA  45.65 
 
 
104 aa  46.2  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.450939  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1819  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.72 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.420216  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  37.1 
 
 
110 aa  44.3  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  40.38 
 
 
87 aa  44.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  56.25 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.39 
 
 
106 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  33.87 
 
 
71 aa  43.9  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.95 
 
 
99 aa  43.5  0.0009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.93 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3135  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  58.82 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.31465  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  33.71 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3836  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.71 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.647162 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1503  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48.57 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.432776  hitchhiker  0.000608688 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  54.55 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  35.14 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1600  twin-arginine translocation protein TatB, putative  37.29 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0401964  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1482  sec-independent protein translocase TatB  37.29 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.338937  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.5 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.59 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0534  Sec-independent protein translocase TatA  28.89 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1346  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.29 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38.1 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  46.51 
 
 
73 aa  41.2  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  25 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  37.74 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  34.43 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  37.74 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  34.43 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.68 
 
 
234 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  37.74 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  30.85 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  31.91 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  29.79 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  45.45 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0190  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.86 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000115386  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  34.92 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  38.1 
 
 
88 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>