51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4378 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4378  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  100 
 
 		 69 aa  142  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.600878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4869  twin arginine-targeting protein translocase  60 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.115935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2607  twin arginine-targeting protein translocase  60 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181166  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12129  twin arginine translocase protein A  56.52 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119011  normal  0.626487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3667  twin arginine-targeting protein translocase  53.33 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  54.35 
 
 		 84 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  43.14 
 
 		 82 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38.24 
 
 		 86 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  51.35 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  51.35 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  51.35 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2305  twin arginine translocase protein A  60 
 
 		 94 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0188826  normal  0.0162961 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  42.59 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3980  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.05 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368125  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2251  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.11 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.624721  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1459  sec-independent protein translocase  39.66 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0926084  normal  0.0392107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5859  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  55.56 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6972  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  57.14 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1204  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  61.29 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2468  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  64.29 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.134961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3893  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  58.06 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000775372  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2689  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  64.29 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.5 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1882  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  62.07 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1780  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  66.67 
 
 		 67 aa  43.9  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000204006  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4849  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.18 
 
 		 56 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00272525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1046  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.67 
 
 		 59 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00953669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18530  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  62.96 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0332142  decreased coverage  0.00893017 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1290  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  62.96 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1926  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.6 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000393248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4461  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.09 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.408951 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1252  twin argininte translocase protein A  37.21 
 
 		 63 aa  42  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2319  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0069  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  66.67 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  40 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  38.64 
 
 		 90 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2252  twin arginine translocase protein A  64.29 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118258  normal  0.775201 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  40.91 
 
 		 61 aa  40.8  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  40.91 
 
 		 61 aa  40.8  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  40.91 
 
 		 61 aa  40.8  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  40.91 
 
 		 61 aa  40.8  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  40.91 
 
 		 61 aa  40.8  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2370  twin arginine translocase protein A  64.29 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.730984  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  40.91 
 
 		 61 aa  40.8  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  40.91 
 
 		 61 aa  40.8  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  40.91 
 
 		 61 aa  40.8  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  40.91 
 
 		 61 aa  40.8  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  40.91 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1823  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1515  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.65 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00781786  normal  0.224045 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21960  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  50 
 
 		 107 aa  40  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148281  normal  0.304965 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>