85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2689 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2689  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  100 
 
 		 108 aa  207  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4869  twin arginine-targeting protein translocase  66 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.115935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2607  twin arginine-targeting protein translocase  64 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181166  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  47.62 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  57.14 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12129  twin arginine translocase protein A  34.21 
 
 		 115 aa  62  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119011  normal  0.626487 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  39.13 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  39.13 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  39.13 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4378  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50 
 
 		 69 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.600878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.33 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3667  twin arginine-targeting protein translocase  55.1 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3980  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.86 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368125  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2319  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2251  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.624721  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1204  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  59.18 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1503  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  60.71 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.432776  hitchhiker  0.000608688 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1926  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  46.03 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000393248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2370  twin arginine translocase protein A  56 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.730984  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2252  twin arginine translocase protein A  56 
 
 		 100 aa  52.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118258  normal  0.775201 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2305  twin arginine translocase protein A  74.19 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0188826  normal  0.0162961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6972  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.64 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  39.18 
 
 		 207 aa  51.6  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1882  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  65.79 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18530  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  42.86 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0332142  decreased coverage  0.00893017 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2468  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  67.5 
 
 		 89 aa  50.8  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.134961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3893  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48 
 
 		 98 aa  50.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000775372  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  46.43 
 
 		 81 aa  50.4  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4849  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50 
 
 		 56 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00272525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1046  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.07 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00953669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5859  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  59.57 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1515  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  61.7 
 
 		 95 aa  48.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00781786  normal  0.224045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4453  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.96 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  normal  0.0943376 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.83 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0781  twin arginine translocase protein A  34.21 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0308647 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2352  twin arginine translocase protein A  49.02 
 
 		 56 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2183  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00719783  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  51.22 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1290  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  59.38 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.67 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0744  twin arginine translocase protein A  32.89 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632356  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21960  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  38.36 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148281  normal  0.304965 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1252  twin argininte translocase protein A  40.43 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2652  twin arginine-targeting protein translocase  49.21 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.572667  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  41.27 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  42.62 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.11 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1769  twin-arginine translocation protein TatA/E  46.3 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  50 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1933  twin arginine translocase protein A  46.81 
 
 		 55 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00450459  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1725  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2439  hypothetical protein  48.84 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1749  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1041  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  30.38 
 
 		 77 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0981  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1082  twin arginine-targeting protein translocase  30.38 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  41.67 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1459  sec-independent protein translocase  50 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0926084  normal  0.0392107 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0244  twin-arginine translocation protein TatA/E  47.73 
 
 		 56 aa  42.7  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.317121  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.58 
 
 		 94 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.74 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  45.83 
 
 		 122 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4461  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.86 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.408951 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  52.63 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3836  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.647162 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.5 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1780  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.67 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000204006  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2323  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.35 
 
 		 63 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.405896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4360  twin arginine translocase protein A  27.27 
 
 		 84 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4204  twin arginine translocase protein A  27.27 
 
 		 84 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0191  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.82 
 
 		 62 aa  40  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0104423  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4181  twin arginine translocase protein A  27.27 
 
 		 84 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4300  twin arginine translocase protein A  27.27 
 
 		 84 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4253  twin arginine translocase protein A  27.27 
 
 		 84 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.67 
 
 		 74 aa  40  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>