54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3893 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3893  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  100 
 
 
98 aa  183  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000775372  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3980  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  68.57 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368125  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  59.26 
 
 
84 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  46.07 
 
 
82 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  59.18 
 
 
79 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  59.18 
 
 
79 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  59.18 
 
 
79 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12129  twin arginine translocase protein A  55.77 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119011  normal  0.626487 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1204  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48.78 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397153  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.94 
 
 
86 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2370  twin arginine translocase protein A  54 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.730984  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3667  twin arginine-targeting protein translocase  55.1 
 
 
74 aa  58.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2252  twin arginine translocase protein A  54 
 
 
100 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118258  normal  0.775201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6972  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.86 
 
 
82 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2607  twin arginine-targeting protein translocase  50 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181166  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2468  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  59.09 
 
 
89 aa  57  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.134961  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4869  twin arginine-targeting protein translocase  48 
 
 
98 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.115935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2305  twin arginine translocase protein A  70.97 
 
 
94 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0188826  normal  0.0162961 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1882  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  74.19 
 
 
98 aa  52.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217317  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  45.1 
 
 
71 aa  52.4  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18530  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  44.83 
 
 
95 aa  51.2  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0332142  decreased coverage  0.00893017 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2319  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48 
 
 
103 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4453  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48.15 
 
 
87 aa  50.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  normal  0.0943376 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21960  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  41.27 
 
 
107 aa  50.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148281  normal  0.304965 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  43.18 
 
 
73 aa  49.7  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2060  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38.64 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.220179  normal  0.159543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1515  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.85 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00781786  normal  0.224045 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1780  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000204006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5859  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  71.43 
 
 
107 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86878  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1926  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.27 
 
 
90 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000393248 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1290  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.67 
 
 
94 aa  47  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38.98 
 
 
74 aa  46.2  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2251  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.19 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.624721  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  39.68 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4378  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.600878  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2689  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  58.06 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1503  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  55.88 
 
 
121 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.432776  hitchhiker  0.000608688 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0069  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.55 
 
 
60 aa  44.3  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4202  Sec-independent protein translocase protein TatA  32.58 
 
 
88 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1823  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.61 
 
 
105 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2705  twin arginine translocase protein A  35.14 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03840  twin arginine translocase protein A  39.39 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1252  twin argininte translocase protein A  40.43 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2999  twin arginine translocase protein A  40.62 
 
 
82 aa  41.6  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2169  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.1 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.309144  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2872  twin arginine translocase protein A  32.79 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0548189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3219  twin arginine translocase protein A  32.79 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.497525  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3728  twin arginine-targeting protein translocase  32.58 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16030  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  45.83 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.735879  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0589  twin arginine translocase protein A  37.93 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.905934 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1769  twin-arginine translocation protein TatA/E  48.57 
 
 
101 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506415  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2513  twin arginine translocase protein A  30.86 
 
 
78 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.640298  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1788  twin arginine translocase protein A  31.48 
 
 
79 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0412  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36 
 
 
78 aa  40  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>