132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4869 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4869  twin arginine-targeting protein translocase  100 
 
 
98 aa  185  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.115935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2607  twin arginine-targeting protein translocase  67.33 
 
 
107 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181166  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2251  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  76 
 
 
114 aa  81.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.624721  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3667  twin arginine-targeting protein translocase  69.39 
 
 
74 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  46.25 
 
 
82 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2319  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  64 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1204  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  60.78 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397153  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3980  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50.75 
 
 
103 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368125  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12129  twin arginine translocase protein A  44.59 
 
 
115 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119011  normal  0.626487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5859  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  71.93 
 
 
107 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86878  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4378  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  52.54 
 
 
69 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.600878  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1515  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.85 
 
 
95 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00781786  normal  0.224045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2689  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  64.29 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2305  twin arginine translocase protein A  72 
 
 
94 aa  57.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0188826  normal  0.0162961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  56 
 
 
84 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1503  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  57.45 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.432776  hitchhiker  0.000608688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.37 
 
 
86 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  47.54 
 
 
79 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  47.54 
 
 
79 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  47.54 
 
 
79 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2252  twin arginine translocase protein A  70 
 
 
100 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118258  normal  0.775201 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3893  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.17 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000775372  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2370  twin arginine translocase protein A  70 
 
 
100 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.730984  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1290  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.57 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4453  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.83 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  normal  0.0943376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6972  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52 
 
 
82 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2652  twin arginine-targeting protein translocase  65.96 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.572667  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.11 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.11 
 
 
87 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  40.62 
 
 
81 aa  51.2  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3682  twin arginine-targeting protein translocase  43.4 
 
 
60 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000036766  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1882  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  67.74 
 
 
98 aa  50.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217317  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2352  twin arginine translocase protein A  46 
 
 
56 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2468  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  70.97 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.134961  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21960  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  50 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148281  normal  0.304965 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1926  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.18 
 
 
90 aa  48.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000393248 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0191  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.37 
 
 
62 aa  48.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0104423  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  34.38 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1933  twin arginine translocase protein A  44 
 
 
55 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00450459  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  28.74 
 
 
92 aa  47.4  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  31.43 
 
 
74 aa  47.4  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18530  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  64.52 
 
 
95 aa  47.8  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0332142  decreased coverage  0.00893017 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.83 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  40.91 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.83 
 
 
139 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.83 
 
 
139 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  46.81 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1780  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  59.46 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000204006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  46.81 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  46.81 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  46.81 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1769  twin-arginine translocation protein TatA/E  43.14 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  46.81 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  57.89 
 
 
99 aa  46.2  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  46.81 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  46.81 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  46.81 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  46.81 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2724  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.5 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  37.14 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1104  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  63.64 
 
 
50 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1823  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  54.05 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  40.43 
 
 
194 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1725  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.1 
 
 
58 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4461  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.3 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.408951 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1749  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.1 
 
 
58 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  34.29 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  30.53 
 
 
110 aa  45.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 
59 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  39.13 
 
 
207 aa  44.3  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0292  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  39.68 
 
 
89 aa  44.3  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328055  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.33 
 
 
94 aa  44.3  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.5 
 
 
69 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  30.85 
 
 
103 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1987  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  44.83 
 
 
71 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283995  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1041  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.48 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  28.74 
 
 
92 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  38.57 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1094  twin arginine-targeting protein translocase  35.21 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0814  twin arginine translocase protein A  30.95 
 
 
83 aa  42.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514575  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0974  Sec-independent protein translocase TatA  38.46 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.450939  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.5 
 
 
189 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1023  twin arginine-targeting protein translocase  42.5 
 
 
59 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1082  twin arginine-targeting protein translocase  32.76 
 
 
77 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1252  twin argininte translocase protein A  34 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0941  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.22 
 
 
55 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4849  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  44.9 
 
 
56 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00272525  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2323  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.18 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.405896  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  45 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  39.13 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  41.67 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2485  twin arginine translocase protein A  32.93 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.359725  normal  0.0181942 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0069  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.22 
 
 
60 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1046  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.24 
 
 
59 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00953669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2183  twin arginine translocase protein A  32.91 
 
 
90 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.487646  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2060  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.66 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.220179  normal  0.159543 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0226  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  61.29 
 
 
51 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000363266  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1396  twin arginine-targeting protein translocase  42.86 
 
 
104 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.419367  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>