156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3980 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3980  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  100 
 
 		 103 aa  204  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368125  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3893  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  68.57 
 
 		 98 aa  97.8  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000775372  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  57.14 
 
 		 84 aa  84  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  62.96 
 
 		 82 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  50 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  50 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  50 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12129  twin arginine translocase protein A  59.32 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119011  normal  0.626487 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1204  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.53 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.67 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2370  twin arginine translocase protein A  60.78 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.730984  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2252  twin arginine translocase protein A  60.78 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118258  normal  0.775201 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18530  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  47.19 
 
 		 95 aa  60.1  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0332142  decreased coverage  0.00893017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6972  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.77 
 
 		 82 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  38.57 
 
 		 71 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3667  twin arginine-targeting protein translocase  59.18 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2319  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.55 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4869  twin arginine-targeting protein translocase  54 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.115935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2607  twin arginine-targeting protein translocase  52 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181166  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2305  twin arginine translocase protein A  77.42 
 
 		 94 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0188826  normal  0.0162961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1515  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  61.22 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00781786  normal  0.224045 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  34.15 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1780  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000204006  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2468  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  57.78 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.134961  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4453  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.79 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  normal  0.0943376 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  41.86 
 
 		 73 aa  53.5  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1503  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  58.54 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.432776  hitchhiker  0.000608688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2251  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.16 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.624721  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2790  twin arginine translocase protein A  34.15 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0371592  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5554  twin arginine translocase protein A  35.53 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.80239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21960  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  45.95 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148281  normal  0.304965 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1882  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  68.75 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1788  twin arginine translocase protein A  33.77 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1926  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48.94 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000393248 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2689  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  55 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2513  twin arginine translocase protein A  32.93 
 
 		 78 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.640298  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1290  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.81 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4378  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  54.05 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.600878  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4202  Sec-independent protein translocase protein TatA  35.79 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1779  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00352153  hitchhiker  0.00879203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4417  twin arginine translocase protein A  38.46 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.831215 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03729  twin arginate translocase protein A  37.5 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4143  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.5 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2060  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.51 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.220179  normal  0.159543 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03678  hypothetical protein  37.5 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0593  twin arginine-targeting protein translocase  35.59 
 
 		 90 aa  47  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0778682  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4060  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4357  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4172  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4219  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000534465 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4308  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5277  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274389  normal  0.174664 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1053  twin arginine translocase protein A  32.93 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2745  twin arginine translocase protein A  33.8 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.254475  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2999  twin arginine translocase protein A  36.07 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0258  twin arginine translocase protein A  44.19 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0612508  hitchhiker  0.00415205 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3554  twin arginine-targeting protein translocase  36.9 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0402  twin arginine-targeting protein translocase  36.9 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3189  twin arginine translocase protein A  37.25 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681948  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3375  twin arginine translocase protein A  28.95 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3728  twin arginine-targeting protein translocase  36.47 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2705  twin arginine translocase protein A  33.73 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4253  twin arginine translocase protein A  34.38 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0069  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50.94 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4204  twin arginine translocase protein A  34.38 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4300  twin arginine translocase protein A  34.38 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4181  twin arginine translocase protein A  34.38 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.96 
 
 		 74 aa  45.1  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0706  twin arginine translocase protein A  34.62 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.121051  normal  0.444547 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0781  twin arginine translocase protein A  27.85 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0308647 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0744  twin arginine translocase protein A  27.85 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632356  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4360  twin arginine translocase protein A  34.38 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2872  twin arginine translocase protein A  31.34 
 
 		 85 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0548189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3219  twin arginine translocase protein A  31.34 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.497525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3100  twin arginine translocase protein A  30.56 
 
 		 73 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1749  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.25 
 
 		 58 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3957  twin arginine translocase protein A  35.94 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0707519 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1725  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.25 
 
 		 58 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0412  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.66 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0116  twin arginine translocase protein A  30.16 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0339  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0542  twin arginine-targeting protein translocase  45 
 
 		 54 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3237  twin arginine translocase protein A  28.38 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0354  twin arginine translocase protein A  40 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0363  twin arginine translocase protein A  40 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3534  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36939  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2671  twin arginine translocase protein A  40 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0436  twin arginine translocase protein A  40 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.510795  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00565  twin arginine translocase protein A  36.07 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0415  twin arginine translocase protein A  40 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00507108 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3045  Sec-independent protein translocase protein TatA  26.39 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2703  twin arginine translocase protein A  40 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3682  twin arginine translocase protein A  40 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.759225  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1972  twin arginine-targeting protein translocase  43.9 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113539  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0814  twin arginine translocase protein A  31.03 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3250  twin arginine translocase protein A  40 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1799  twin arginine translocase protein A  40 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3655  twin arginine translocase protein A  40 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3713  twin arginine translocase protein A  40 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2754  twin arginine translocase protein A  40 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>