73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1882 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1882  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  100 
 
 		 98 aa  197  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  52.17 
 
 		 79 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  52.17 
 
 		 79 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  52.17 
 
 		 79 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12129  twin arginine translocase protein A  57.41 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119011  normal  0.626487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  49.28 
 
 		 82 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1926  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50 
 
 		 90 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000393248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  60 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1204  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  65.91 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2468  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.52 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.134961  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3667  twin arginine-targeting protein translocase  61.7 
 
 		 74 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2183  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  56.14 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00719783  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  31.87 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3980  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  58.14 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368125  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14010  Sec-independent protein secretion pathway component  56.6 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0143523  normal  0.0843722 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2607  twin arginine-targeting protein translocase  53.66 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181166  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2169  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  60 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.309144  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4869  twin arginine-targeting protein translocase  53.66 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.115935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6972  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.64 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3893  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  58.14 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000775372  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21960  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  40.23 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148281  normal  0.304965 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4453  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  42.67 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  normal  0.0943376 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2305  twin arginine translocase protein A  76.67 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0188826  normal  0.0162961 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1780  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.17 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000204006  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2252  twin arginine translocase protein A  59.57 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118258  normal  0.775201 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1252  twin argininte translocase protein A  45.65 
 
 		 63 aa  51.6  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2370  twin arginine translocase protein A  59.57 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.730984  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2689  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  64.86 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1503  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  57.14 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.432776  hitchhiker  0.000608688 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16030  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  52.94 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.735879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5859  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  58.97 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2251  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.55 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.624721  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4378  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.33 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.600878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0981  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.94 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2652  twin arginine-targeting protein translocase  41.18 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.572667  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1869  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.28 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0618577  normal  0.146406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2060  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.83 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.220179  normal  0.159543 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18530  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  56.67 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0332142  decreased coverage  0.00893017 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  42.31 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  42.31 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  42.31 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  42.31 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1515  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.55 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00781786  normal  0.224045 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  42.31 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  42.31 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  42.31 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1290  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.67 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  42.31 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  42.31 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0069  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.55 
 
 		 60 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2319  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.89 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11960  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  49.15 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00933291  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0190  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.86 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000115386  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0244  twin-arginine translocation protein TatA/E  39.58 
 
 		 56 aa  45.1  0.0004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.317121  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  43.48 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  35.42 
 
 		 73 aa  44.7  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  49.09 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.18 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  40.38 
 
 		 59 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  36.59 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  40.32 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.84 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  35.9 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1005  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  37.1 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.43 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  37.25 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  37.25 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  32.5 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38.3 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.33 
 
 		 90 aa  40.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  36.73 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  37.04 
 
 		 111 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>