133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2705 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2705  twin arginine translocase protein A  100 
 
 
81 aa  162  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0589  twin arginine translocase protein A  68.29 
 
 
82 aa  110  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.905934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4417  twin arginine translocase protein A  64.62 
 
 
77 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3189  twin arginine translocase protein A  69.23 
 
 
78 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681948  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2790  twin arginine translocase protein A  60.26 
 
 
79 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0371592  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3399  twin arginine translocase protein A  55.56 
 
 
95 aa  87  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3708  twin arginine translocase protein A  55.56 
 
 
95 aa  87  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0454657  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2745  twin arginine translocase protein A  62.5 
 
 
79 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.254475  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2513  twin arginine translocase protein A  63.51 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.640298  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3590  twin arginine translocase protein A  54.17 
 
 
91 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.744358  normal  0.70676 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1788  twin arginine translocase protein A  63.64 
 
 
79 aa  84  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1779  twin arginine translocase protein A  57.14 
 
 
78 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00352153  hitchhiker  0.00879203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2485  twin arginine translocase protein A  49.4 
 
 
88 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.359725  normal  0.0181942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2183  twin arginine translocase protein A  50.67 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.487646  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2764  twin arginine translocase protein A  68.75 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0594411  normal  0.122404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3930  twin arginine translocase protein A  61.43 
 
 
85 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2668  SEC-independent protein translocase protein  58.21 
 
 
71 aa  70.5  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.598915  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4407  twin arginine translocase protein A  81.63 
 
 
78 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1094  twin arginine-targeting protein translocase  51.56 
 
 
83 aa  66.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1143  twin arginine translocase protein A  60.94 
 
 
77 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3119  twin arginine-targeting protein translocase  56.67 
 
 
74 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0514819  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1416  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  59.65 
 
 
88 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1685  twin arginine translocase protein A  53.03 
 
 
64 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1164  twin arginine translocase protein A  56.72 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0248599  normal  0.16996 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2345  twin arginine translocase protein A  48.1 
 
 
76 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172341  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1806  twin arginine translocase protein A  47.95 
 
 
71 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0839673  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1487  twin arginine translocase protein A  51.52 
 
 
63 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_004310  BR0882  twin arginine translocase protein A  47.5 
 
 
80 aa  57.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2610  twin arginine-targeting protein translocase  50 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0873  twin arginine translocase protein A  47.5 
 
 
80 aa  57.8  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1773  twin-arginine translocation protein TatA/E  51.47 
 
 
96 aa  57  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0016  twin arginine-targeting protein translocase  44.71 
 
 
85 aa  55.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3100  twin arginine translocase protein A  39.06 
 
 
73 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3549  twin arginine translocase protein A  43.55 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0475634  hitchhiker  0.000865371 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3027  twin arginine-targeting protein translocase  54 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190632  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3795  twin arginine-targeting protein translocase  35.06 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743518  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3219  twin arginine translocase protein A  38.89 
 
 
85 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.497525  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2872  twin arginine translocase protein A  38.89 
 
 
85 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0548189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3237  twin arginine translocase protein A  40.32 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  42.67 
 
 
79 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  42.67 
 
 
79 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0781  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 
82 aa  51.2  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0308647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  42.67 
 
 
79 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2748  twin arginine translocase protein A  41.94 
 
 
78 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665647  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0706  twin arginine translocase protein A  30.99 
 
 
84 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.121051  normal  0.444547 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3375  twin arginine translocase protein A  40.98 
 
 
76 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0744  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632356  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1909  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.98 
 
 
74 aa  50.8  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.925772  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0814  twin arginine translocase protein A  29.63 
 
 
83 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514575  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3728  twin arginine-targeting protein translocase  35.44 
 
 
85 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  50.98 
 
 
71 aa  50.4  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1343  Sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.16 
 
 
74 aa  50.1  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.139725 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  41.67 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1053  twin arginine translocase protein A  35.9 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4202  Sec-independent protein translocase protein TatA  32.89 
 
 
88 aa  49.7  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0015  twin arginine-targeting protein translocase  41.98 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  39.19 
 
 
73 aa  49.3  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001924  twin-arginine translocation protein TatA  37.31 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5554  twin arginine translocase protein A  40.32 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.80239  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2942  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0409  twin arginine translocase protein A  40.32 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3554  twin arginine-targeting protein translocase  33.33 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0402  twin arginine-targeting protein translocase  33.33 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0116  twin arginine translocase protein A  35.71 
 
 
73 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0115  twin arginine translocase protein A  36.23 
 
 
73 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4181  twin arginine translocase protein A  44.23 
 
 
84 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4360  twin arginine translocase protein A  44.23 
 
 
84 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4253  twin arginine translocase protein A  44.23 
 
 
84 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4300  twin arginine translocase protein A  44.23 
 
 
84 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111874  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4204  twin arginine translocase protein A  44.23 
 
 
84 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2999  twin arginine translocase protein A  36.21 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1079  twin arginine-targeting protein translocase  33.8 
 
 
102 aa  47  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000000000641532  normal  0.697921 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2703  twin arginine translocase protein A  35.21 
 
 
77 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3682  twin arginine translocase protein A  35.21 
 
 
77 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.759225  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3534  twin arginine translocase protein A  40.62 
 
 
76 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36939  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3250  twin arginine translocase protein A  35.21 
 
 
77 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1799  twin arginine translocase protein A  35.21 
 
 
77 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3655  twin arginine translocase protein A  35.21 
 
 
77 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3713  twin arginine translocase protein A  35.21 
 
 
77 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2754  twin arginine translocase protein A  35.21 
 
 
77 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2982  twin arginine translocase protein A  40.68 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0258  twin arginine translocase protein A  43.48 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0612508  hitchhiker  0.00415205 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2671  twin arginine translocase protein A  40 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0354  twin arginine translocase protein A  40 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0436  twin arginine translocase protein A  40 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.510795  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0320  twin arginine-targeting protein translocase  34.72 
 
 
88 aa  46.2  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3420  twin arginine-targeting protein translocase  32.86 
 
 
75 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.984089  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00565  twin arginine translocase protein A  38.89 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0339  twin arginine translocase protein A  41.51 
 
 
76 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11873  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0415  twin arginine translocase protein A  40 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00507108 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0363  twin arginine translocase protein A  40 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3898  twin arginine-targeting protein translocase  34.85 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  40.68 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3957  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0707519 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3760  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.39 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0416  twin arginine-targeting protein translocase  34.85 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0442  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.85 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0428  twin arginine-targeting protein translocase  34.85 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000041421 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2540  twin-arginine translocation system protein, TatA  46.81 
 
 
70 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.540586  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1199  twin arginine-targeting protein translocase  46.81 
 
 
70 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0780596 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>