169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1788 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1788  twin arginine translocase protein A  100 
 
 		 79 aa  160  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1779  twin arginine translocase protein A  89.47 
 
 		 78 aa  141  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00352153  hitchhiker  0.00879203 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2513  twin arginine translocase protein A  83.33 
 
 		 78 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.640298  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2790  twin arginine translocase protein A  85.71 
 
 		 79 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0371592  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3189  twin arginine translocase protein A  81.58 
 
 		 78 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681948  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4417  twin arginine translocase protein A  84.21 
 
 		 77 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2745  twin arginine translocase protein A  80.52 
 
 		 79 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.254475  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3708  twin arginine translocase protein A  56.41 
 
 		 95 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0454657  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3399  twin arginine translocase protein A  56.41 
 
 		 95 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3590  twin arginine translocase protein A  56.41 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.744358  normal  0.70676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2705  twin arginine translocase protein A  63.64 
 
 		 81 aa  84  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2764  twin arginine translocase protein A  74.47 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0594411  normal  0.122404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2183  twin arginine translocase protein A  52.38 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.487646  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0589  twin arginine translocase protein A  61.76 
 
 		 82 aa  82  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.905934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2485  twin arginine translocase protein A  52.87 
 
 		 88 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.359725  normal  0.0181942 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1685  twin arginine translocase protein A  61.9 
 
 		 64 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2668  SEC-independent protein translocase protein  61.19 
 
 		 71 aa  71.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.598915  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1487  twin arginine translocase protein A  60.32 
 
 		 63 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4407  twin arginine translocase protein A  81.25 
 
 		 78 aa  70.1  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1806  twin arginine translocase protein A  56.06 
 
 		 71 aa  70.1  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0839673  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1164  twin arginine translocase protein A  65.62 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0248599  normal  0.16996 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3930  twin arginine translocase protein A  58.62 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1094  twin arginine-targeting protein translocase  50.88 
 
 		 83 aa  68.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1143  twin arginine translocase protein A  57.81 
 
 		 77 aa  67.8  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2345  twin arginine translocase protein A  60.32 
 
 		 76 aa  67.4  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172341  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0882  twin arginine translocase protein A  63.64 
 
 		 80 aa  67  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0873  twin arginine translocase protein A  63.64 
 
 		 80 aa  67  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2610  twin arginine-targeting protein translocase  54 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1416  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.41 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3119  twin arginine-targeting protein translocase  63.83 
 
 		 74 aa  63.5  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0514819  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1773  twin-arginine translocation protein TatA/E  74.47 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2703  twin arginine translocase protein A  35.06 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3682  twin arginine translocase protein A  35.06 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.759225  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3250  twin arginine translocase protein A  35.06 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1799  twin arginine translocase protein A  35.06 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3655  twin arginine translocase protein A  35.06 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3713  twin arginine translocase protein A  35.06 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2754  twin arginine translocase protein A  35.06 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0744  twin arginine translocase protein A  34.18 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632356  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2982  twin arginine translocase protein A  35.06 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0354  twin arginine translocase protein A  36.11 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0781  twin arginine translocase protein A  34.18 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0308647 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0363  twin arginine translocase protein A  36.11 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0339  twin arginine translocase protein A  36.11 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2748  twin arginine translocase protein A  37.18 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0016  twin arginine-targeting protein translocase  45.83 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  46.15 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3534  twin arginine translocase protein A  34.72 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36939  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0814  twin arginine translocase protein A  33.73 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  54.35 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5554  twin arginine translocase protein A  37.31 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.80239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0415  twin arginine translocase protein A  34.72 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00507108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2671  twin arginine translocase protein A  34.72 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0436  twin arginine translocase protein A  34.72 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.510795  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3375  twin arginine translocase protein A  37.7 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2872  twin arginine translocase protein A  38.33 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0548189 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3549  twin arginine translocase protein A  40.74 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0475634  hitchhiker  0.000865371 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3219  twin arginine translocase protein A  38.33 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.497525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3027  twin arginine-targeting protein translocase  66.67 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2942  twin arginine translocase protein A  41.51 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0409  twin arginine translocase protein A  44 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0706  twin arginine translocase protein A  30.56 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.121051  normal  0.444547 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3100  twin arginine translocase protein A  40.91 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0116  twin arginine translocase protein A  38.24 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1180  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0115  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1053  twin arginine translocase protein A  37.31 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3237  twin arginine translocase protein A  36.67 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0258  twin arginine translocase protein A  42.22 
 
 		 72 aa  52  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0612508  hitchhiker  0.00415205 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0015  twin arginine-targeting protein translocase  57.45 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1343  Sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  43.14 
 
 		 74 aa  51.2  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.139725 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3554  twin arginine-targeting protein translocase  33.33 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0402  twin arginine-targeting protein translocase  33.33 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  41.38 
 
 		 82 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3912  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0542  twin arginine-targeting protein translocase  38.89 
 
 		 54 aa  51.2  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0428  twin arginine-targeting protein translocase  37.31 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000041421 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0442  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.31 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3898  twin arginine-targeting protein translocase  37.31 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  41.38 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0416  twin arginine-targeting protein translocase  37.31 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3205  Sec-independent protein translocase protein TatA  44 
 
 		 77 aa  50.8  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4244  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.88 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0503  twin arginine-targeting protein translocase  35.82 
 
 		 79 aa  50.1  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.38 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3728  twin arginine-targeting protein translocase  33.33 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03729  twin arginate translocase protein A  40.38 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4143  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.38 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4202  Sec-independent protein translocase protein TatA  36.51 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5277  twin arginine translocase protein A  40.38 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274389  normal  0.174664 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  36 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  36 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4219  twin arginine translocase protein A  40.38 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000534465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  36 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4308  twin arginine translocase protein A  40.38 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4172  twin arginine translocase protein A  40.38 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03678  hypothetical protein  40.38 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4060  twin arginine translocase protein A  40.38 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4357  twin arginine translocase protein A  40.38 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3420  twin arginine-targeting protein translocase  28.36 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.984089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>