99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2610 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2610  twin arginine-targeting protein translocase  100 
 
 		 93 aa  188  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3399  twin arginine translocase protein A  57.45 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3590  twin arginine translocase protein A  57.45 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.744358  normal  0.70676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3708  twin arginine translocase protein A  57.45 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0454657  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2764  twin arginine translocase protein A  56.52 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0594411  normal  0.122404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3189  twin arginine translocase protein A  56 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681948  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1779  twin arginine translocase protein A  54 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00352153  hitchhiker  0.00879203 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2745  twin arginine translocase protein A  56 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.254475  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2790  twin arginine translocase protein A  56 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0371592  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1788  twin arginine translocase protein A  54 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2513  twin arginine translocase protein A  56 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.640298  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4417  twin arginine translocase protein A  52 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2345  twin arginine translocase protein A  45.31 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172341  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2183  twin arginine translocase protein A  41.27 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.487646  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0589  twin arginine translocase protein A  54 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.905934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2485  twin arginine translocase protein A  48 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.359725  normal  0.0181942 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2705  twin arginine translocase protein A  50 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1685  twin arginine translocase protein A  48.33 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2668  SEC-independent protein translocase protein  56.52 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.598915  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0873  twin arginine translocase protein A  46.3 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1164  twin arginine translocase protein A  44.12 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0248599  normal  0.16996 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1806  twin arginine translocase protein A  45 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0839673  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2999  twin arginine translocase protein A  36.49 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0882  twin arginine translocase protein A  46.3 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1094  twin arginine-targeting protein translocase  50 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1487  twin arginine translocase protein A  46.67 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4407  twin arginine translocase protein A  57.78 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0152  mttA/Hcf106 family protein  50 
 
 		 55 aa  52.4  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1773  twin-arginine translocation protein TatA/E  46 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3930  twin arginine translocase protein A  44.62 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1143  twin arginine translocase protein A  54.35 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3376  twin arginine-targeting protein translocase  41.18 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0852423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4099  twin arginine-targeting protein translocase  39.71 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.966415 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001924  twin-arginine translocation protein TatA  45.45 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00565  twin arginine translocase protein A  45.45 
 
 		 82 aa  50.4  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3728  twin arginine-targeting protein translocase  37.31 
 
 		 85 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3898  twin arginine-targeting protein translocase  42.59 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0524  twin arginine-targeting protein translocase  34.29 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.897575 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0442  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.59 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0416  twin arginine-targeting protein translocase  42.59 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1343  Sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  42.55 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.139725 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0428  twin arginine-targeting protein translocase  42.59 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000041421 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3957  twin arginine translocase protein A  38.78 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0707519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0503  twin arginine-targeting protein translocase  40.74 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0472  twin arginine-targeting protein translocase  40.85 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3795  twin arginine-targeting protein translocase  36.07 
 
 		 89 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743518  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0320  twin arginine-targeting protein translocase  38.46 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3119  twin arginine-targeting protein translocase  41.38 
 
 		 74 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0514819  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2429  twin arginine translocase protein A  39.13 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3205  Sec-independent protein translocase protein TatA  43.48 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3045  Sec-independent protein translocase protein TatA  40.43 
 
 		 79 aa  48.9  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4253  twin arginine translocase protein A  36.73 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4172  twin arginine translocase protein A  35.29 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4143  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.29 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4219  twin arginine translocase protein A  35.29 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000534465 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03678  hypothetical protein  35.29 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5277  twin arginine translocase protein A  35.29 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274389  normal  0.174664 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4360  twin arginine translocase protein A  36.73 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4204  twin arginine translocase protein A  36.73 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4181  twin arginine translocase protein A  36.73 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4300  twin arginine translocase protein A  36.73 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4308  twin arginine translocase protein A  35.29 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03729  twin arginate translocase protein A  35.29 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4202  Sec-independent protein translocase protein TatA  33.33 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4357  twin arginine translocase protein A  35.29 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4060  twin arginine translocase protein A  35.29 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3554  twin arginine-targeting protein translocase  41.3 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0402  twin arginine-targeting protein translocase  41.3 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1972  twin arginine-targeting protein translocase  35.82 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113539  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3027  twin arginine-targeting protein translocase  58.97 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0244  twin-arginine translocation protein TatA/E  35.85 
 
 		 56 aa  46.2  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.317121  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1909  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  44.12 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.925772  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3912  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.39 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1209  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.86 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0981  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.35 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0251  twin arginine-targeting protein translocase  36.36 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.293668 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3420  twin arginine-targeting protein translocase  36.07 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.984089  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0593  twin arginine-targeting protein translocase  36.54 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0778682  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1416  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.9 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3942  twin arginine-targeting protein translocase  36.07 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3638  Sec-independent protein translocase protein TatA  36.07 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1619  twin arginine-targeting protein translocase  35.38 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.208284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0274  twin arginine-targeting protein translocase TatA  36.07 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0015  twin arginine-targeting protein translocase  44.44 
 
 		 75 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2971  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.55 
 
 		 69 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00309368  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1174  twin arginine translocase protein A  38.64 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000428272  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3760  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.13 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4244  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.36 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  40.98 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1194  twin arginine translocase protein A  36.51 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1199  twin arginine-targeting protein translocase  44.74 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0780596 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2540  twin-arginine translocation system protein, TatA  44.74 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.540586  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3157  twin arginine translocase protein A  36.36 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000988339  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1983  twin arginine-targeting protein translocase  42.11 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.830772  normal  0.0374127 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2623  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1332  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0258  twin arginine translocase protein A  31.15 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0612508  hitchhiker  0.00415205 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2527  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.190921  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1797  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  61.54 
 
 		 71 aa  40  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00956825  normal  0.0641445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>