65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1797 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1797  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  100 
 
 		 71 aa  137  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00956825  normal  0.0641445 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1343  Sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  75.68 
 
 		 74 aa  104  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.139725 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1199  twin arginine-targeting protein translocase  72.86 
 
 		 70 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0780596 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1983  twin arginine-targeting protein translocase  71.43 
 
 		 70 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.830772  normal  0.0374127 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2540  twin-arginine translocation system protein, TatA  72.86 
 
 		 70 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.540586  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1209  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  51.85 
 
 		 96 aa  73.6  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0907  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  78.33 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4481  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3102  Sec-independent protein translocase TatE  63.04 
 
 		 63 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.101906  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3830  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  63.04 
 
 		 63 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3158 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1094  twin arginine-targeting protein translocase  44.78 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3399  twin arginine translocase protein A  48.15 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3708  twin arginine translocase protein A  48.15 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0454657  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2745  twin arginine translocase protein A  43.33 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.254475  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3189  twin arginine translocase protein A  41.94 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681948  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2790  twin arginine translocase protein A  47.06 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0371592  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4417  twin arginine translocase protein A  39.13 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3590  twin arginine translocase protein A  61.11 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.744358  normal  0.70676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2764  twin arginine translocase protein A  48.89 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0594411  normal  0.122404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2513  twin arginine translocase protein A  54.17 
 
 		 78 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.640298  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2183  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 		 90 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.487646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  46.55 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  46.55 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2485  twin arginine translocase protein A  55.56 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.359725  normal  0.0181942 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  46.55 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  46.55 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  46.55 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  46.55 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1788  twin arginine translocase protein A  43.14 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  46.55 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  46.55 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1779  twin arginine translocase protein A  43.14 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00352153  hitchhiker  0.00879203 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  46.55 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2705  twin arginine translocase protein A  39.73 
 
 		 81 aa  49.7  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2610  twin arginine-targeting protein translocase  44.9 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0589  twin arginine translocase protein A  55.1 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.905934 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  44.83 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  40.32 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1685  twin arginine translocase protein A  45.71 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0524  twin arginine-targeting protein translocase  39.13 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.897575 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3119  twin arginine-targeting protein translocase  37.7 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0514819  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0917  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.1 
 
 		 62 aa  43.5  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  33.87 
 
 		 88 aa  43.9  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0292  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40.68 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328055  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4407  twin arginine translocase protein A  76.92 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.29 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0503  twin arginine-targeting protein translocase  35.21 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1487  twin arginine translocase protein A  50 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00565  twin arginine translocase protein A  31.65 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3898  twin arginine-targeting protein translocase  33.8 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0442  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.8 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0416  twin arginine-targeting protein translocase  33.8 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3027  twin arginine-targeting protein translocase  69.23 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0428  twin arginine-targeting protein translocase  33.8 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000041421 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3930  twin arginine translocase protein A  50 
 
 		 85 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.93 
 
 		 92 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2668  SEC-independent protein translocase protein  69.23 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.598915  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  32.26 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0016  twin arginine-targeting protein translocase  34.85 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1164  twin arginine translocase protein A  57.89 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0248599  normal  0.16996 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1143  twin arginine translocase protein A  51.28 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0244  twin-arginine translocation protein TatA/E  40.38 
 
 		 56 aa  41.2  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.317121  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2345  twin arginine translocase protein A  42.55 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172341  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1174  twin arginine translocase protein A  37.74 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000428272  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1619  twin arginine-targeting protein translocase  45.65 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.208284  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>