41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3102 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3102  Sec-independent protein translocase TatE  100 
 
 		 63 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.101906  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3830  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  100 
 
 		 63 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1343  Sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  57.38 
 
 		 74 aa  75.5  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.139725 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1209  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  58 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0907  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  60.32 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4481  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2540  twin-arginine translocation system protein, TatA  68 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.540586  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1199  twin arginine-targeting protein translocase  68 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0780596 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1983  twin arginine-targeting protein translocase  68 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.830772  normal  0.0374127 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1094  twin arginine-targeting protein translocase  42.37 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1797  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  58.62 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00956825  normal  0.0641445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4417  twin arginine translocase protein A  37.29 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3189  twin arginine translocase protein A  35.59 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681948  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1788  twin arginine translocase protein A  37.29 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2745  twin arginine translocase protein A  36.67 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.254475  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1779  twin arginine translocase protein A  35.59 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00352153  hitchhiker  0.00879203 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2790  twin arginine translocase protein A  36.67 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0371592  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2513  twin arginine translocase protein A  33.9 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.640298  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2485  twin arginine translocase protein A  44 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.359725  normal  0.0181942 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2705  twin arginine translocase protein A  39.29 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3708  twin arginine translocase protein A  42.22 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0454657  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3399  twin arginine translocase protein A  42.22 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3590  twin arginine translocase protein A  41.86 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.744358  normal  0.70676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2183  twin arginine translocase protein A  42 
 
 		 90 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.487646  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0016  twin arginine-targeting protein translocase  47.06 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2764  twin arginine translocase protein A  35.56 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0594411  normal  0.122404 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3682  twin arginine-targeting protein translocase  36.84 
 
 		 60 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000036766  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1174  twin arginine translocase protein A  38.98 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000428272  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3760  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.22 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3027  twin arginine-targeting protein translocase  45 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0589  twin arginine translocase protein A  35.59 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.905934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3119  twin arginine-targeting protein translocase  36 
 
 		 74 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0514819  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2345  twin arginine translocase protein A  42.5 
 
 		 76 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172341  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2971  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.93 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00309368  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4244  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.21 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0524  twin arginine-targeting protein translocase  34.48 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.897575 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3930  twin arginine translocase protein A  47.37 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2610  twin arginine-targeting protein translocase  36.59 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0244  twin-arginine translocation protein TatA/E  38.78 
 
 		 56 aa  41.2  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.317121  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3157  twin arginine translocase protein A  35.59 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000988339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  37.5 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0152  mttA/Hcf106 family protein  40.82 
 
 		 55 aa  40.4  0.008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>