154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3930 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3930  twin arginine translocase protein A  100 
 
 		 85 aa  173  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2183  twin arginine translocase protein A  56.72 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.487646  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2705  twin arginine translocase protein A  61.43 
 
 		 81 aa  87.4  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2485  twin arginine translocase protein A  64.91 
 
 		 88 aa  87  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.359725  normal  0.0181942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3189  twin arginine translocase protein A  50 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681948  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0589  twin arginine translocase protein A  62.5 
 
 		 82 aa  83.2  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.905934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3590  twin arginine translocase protein A  51.9 
 
 		 91 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.744358  normal  0.70676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2764  twin arginine translocase protein A  72.34 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0594411  normal  0.122404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3708  twin arginine translocase protein A  51.9 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0454657  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1779  twin arginine translocase protein A  52.78 
 
 		 78 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00352153  hitchhiker  0.00879203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3399  twin arginine translocase protein A  51.9 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4417  twin arginine translocase protein A  63.64 
 
 		 77 aa  82  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2790  twin arginine translocase protein A  57.58 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0371592  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1788  twin arginine translocase protein A  58.62 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2513  twin arginine translocase protein A  51.39 
 
 		 78 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.640298  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1143  twin arginine translocase protein A  92 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2745  twin arginine translocase protein A  70 
 
 		 79 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.254475  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4407  twin arginine translocase protein A  75 
 
 		 78 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1094  twin arginine-targeting protein translocase  53.45 
 
 		 83 aa  67.8  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3549  twin arginine translocase protein A  46.67 
 
 		 79 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0475634  hitchhiker  0.000865371 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1806  twin arginine translocase protein A  52.17 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0839673  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3237  twin arginine translocase protein A  40.54 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2610  twin arginine-targeting protein translocase  44.62 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1487  twin arginine translocase protein A  71.43 
 
 		 63 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2345  twin arginine translocase protein A  48.1 
 
 		 76 aa  62  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172341  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2668  SEC-independent protein translocase protein  53.42 
 
 		 71 aa  62  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.598915  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0409  twin arginine translocase protein A  43.33 
 
 		 79 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1164  twin arginine translocase protein A  68 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0248599  normal  0.16996 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1685  twin arginine translocase protein A  69.39 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0882  twin arginine translocase protein A  63.46 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0873  twin arginine translocase protein A  63.46 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0524  twin arginine-targeting protein translocase  34.48 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.897575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3100  twin arginine translocase protein A  39.19 
 
 		 73 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2872  twin arginine translocase protein A  41.43 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0548189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3219  twin arginine translocase protein A  41.43 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.497525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3027  twin arginine-targeting protein translocase  71.05 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3375  twin arginine translocase protein A  40.98 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1773  twin-arginine translocation protein TatA/E  56.9 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0814  twin arginine translocase protein A  32.93 
 
 		 83 aa  57  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0016  twin arginine-targeting protein translocase  33.33 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3119  twin arginine-targeting protein translocase  43.28 
 
 		 74 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0514819  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2982  twin arginine translocase protein A  41.67 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4244  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  30.59 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0116  twin arginine translocase protein A  34.78 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3760  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.19 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2748  twin arginine translocase protein A  32.93 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665647  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2703  twin arginine translocase protein A  40 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3682  twin arginine translocase protein A  40 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.759225  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3250  twin arginine translocase protein A  40 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1799  twin arginine translocase protein A  40 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3655  twin arginine translocase protein A  40 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3713  twin arginine translocase protein A  40 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2754  twin arginine translocase protein A  40 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0339  twin arginine translocase protein A  36.62 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0115  twin arginine translocase protein A  38.98 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3795  twin arginine-targeting protein translocase  30.12 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743518  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0363  twin arginine translocase protein A  40 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2671  twin arginine translocase protein A  36.62 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0415  twin arginine translocase protein A  36.62 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00507108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0354  twin arginine translocase protein A  40 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0436  twin arginine translocase protein A  36.62 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.510795  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2429  twin arginine translocase protein A  29.87 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3534  twin arginine translocase protein A  40 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36939  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1053  twin arginine translocase protein A  36.36 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2942  twin arginine translocase protein A  43.14 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0706  twin arginine translocase protein A  39.66 
 
 		 84 aa  52.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.121051  normal  0.444547 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3898  twin arginine-targeting protein translocase  35.29 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3376  twin arginine-targeting protein translocase  31.51 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0852423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0442  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.29 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0416  twin arginine-targeting protein translocase  35.29 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001924  twin-arginine translocation protein TatA  45.1 
 
 		 81 aa  52.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0428  twin arginine-targeting protein translocase  35.29 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000041421 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03729  twin arginate translocase protein A  47.06 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4143  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.06 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4172  twin arginine translocase protein A  47.06 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1416  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.36 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4202  Sec-independent protein translocase protein TatA  32.5 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3554  twin arginine-targeting protein translocase  35.29 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0402  twin arginine-targeting protein translocase  35.29 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3912  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.62 
 
 		 84 aa  52  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03678  hypothetical protein  47.06 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3205  Sec-independent protein translocase protein TatA  35.06 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4308  twin arginine translocase protein A  47.06 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0781  twin arginine translocase protein A  40.35 
 
 		 82 aa  52  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0308647 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4219  twin arginine translocase protein A  47.06 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000534465 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0503  twin arginine-targeting protein translocase  33.82 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5277  twin arginine translocase protein A  47.06 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274389  normal  0.174664 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00565  twin arginine translocase protein A  45.1 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4060  twin arginine translocase protein A  47.06 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4357  twin arginine translocase protein A  47.06 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0258  twin arginine translocase protein A  46.67 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0612508  hitchhiker  0.00415205 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0744  twin arginine translocase protein A  40.35 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632356  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4099  twin arginine-targeting protein translocase  30.67 
 
 		 78 aa  51.6  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.966415 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0472  twin arginine-targeting protein translocase  43.75 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4204  twin arginine translocase protein A  46.81 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4360  twin arginine translocase protein A  46.81 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0015  twin arginine-targeting protein translocase  44.59 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4253  twin arginine translocase protein A  46.81 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4300  twin arginine translocase protein A  46.81 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4181  twin arginine translocase protein A  46.81 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>