34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1003 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1003  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  100 
 
 		 66 aa  130  7.999999999999999e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1005  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  100 
 
 		 77 aa  119  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07460  Twin-arginine translocation protein TatA/E  44.62 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48.53 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.94 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38.81 
 
 		 90 aa  51.2  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1459  sec-independent protein translocase  48.78 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0926084  normal  0.0392107 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  38.81 
 
 		 90 aa  48.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0534  Sec-independent protein translocase TatA  41.18 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  48.78 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0640  twin arginine-targeting protein translocase  47.83 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0666  twin arginine-targeting protein translocase  47.83 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2323  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.22 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.405896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  50 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  41.03 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.86 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1615  twin arginine-targeting protein translocase  43.48 
 
 		 118 aa  43.5  0.0009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4461  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.02 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.408951 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.95 
 
 		 139 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.95 
 
 		 146 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0231  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.33 
 
 		 81 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.74798e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.95 
 
 		 139 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0024  sec-independent protein translocase  51.52 
 
 		 71 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.58 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1748  twin-arginine translocation protein TatA/E  48.48 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0702  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.84 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0624  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.52 
 
 		 70 aa  40.4  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.479059  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  33.96 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1230  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.29 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.892691  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  32.79 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0596  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.48 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0621767 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0577  twin arginine-targeting protein translocase  48.48 
 
 		 65 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>