185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0024 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0024  sec-independent protein translocase  100 
 
 
71 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1459  sec-independent protein translocase  59.68 
 
 
65 aa  73.9  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0926084  normal  0.0392107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2323  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.23 
 
 
63 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.405896  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1332  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  60.29 
 
 
77 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4461  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.24 
 
 
66 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.408951 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.67 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4498  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.25 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  48 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1005  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  52 
 
 
77 aa  58.9  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  50 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.9 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.06 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  51.06 
 
 
91 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  51.06 
 
 
91 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0981  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.32 
 
 
66 aa  57.8  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  57.78 
 
 
122 aa  57  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  47.92 
 
 
91 aa  57  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.81 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2500  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  63.83 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  42.59 
 
 
103 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  42.59 
 
 
89 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  61.22 
 
 
74 aa  55.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  40.35 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  41.38 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  43.4 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44 
 
 
88 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  61.54 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  43.55 
 
 
110 aa  55.1  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2436  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  37.68 
 
 
81 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  38.6 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0941  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.06 
 
 
55 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  53.85 
 
 
81 aa  53.9  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  37.93 
 
 
88 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  46.81 
 
 
90 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 
95 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.82 
 
 
106 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07460  Twin-arginine translocation protein TatA/E  47.17 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.84 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1023  twin arginine-targeting protein translocase  54.76 
 
 
59 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.18 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0942  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.98 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  37.5 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2623  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  60 
 
 
71 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1332  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  60 
 
 
71 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  42.19 
 
 
87 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3836  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  60 
 
 
67 aa  51.6  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.647162 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2527  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  60 
 
 
71 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.190921  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  46.94 
 
 
101 aa  51.2  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.92 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  38.89 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1278  Sec-independent protein translocase TatA  50.85 
 
 
73 aa  50.4  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0109777  hitchhiker  0.00000252177 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0917  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.41 
 
 
62 aa  50.4  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1063  Sec-independent protein translocase TatA  41.82 
 
 
60 aa  50.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0562008 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0781  twin arginine-targeting protein translocase  45.45 
 
 
59 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  53.66 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  33.93 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3682  twin arginine-targeting protein translocase  41.67 
 
 
60 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000036766  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1617  twin-arginine translocation protein TatA/E  34.55 
 
 
71 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  39.62 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1003  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  51.28 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03291  hypothetical protein  34.55 
 
 
71 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58964  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  40.62 
 
 
73 aa  49.3  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4869  twin arginine-targeting protein translocase  45.61 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.115935 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  38.33 
 
 
59 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  45.65 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  45.65 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  45.65 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  45.65 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  45.65 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1748  twin-arginine translocation protein TatA/E  49.12 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  45.65 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  45.65 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  42.86 
 
 
92 aa  48.9  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  45.65 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0577  twin arginine-targeting protein translocase  58.33 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1677  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  37.04 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  45.65 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  35.19 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2607  twin arginine-targeting protein translocase  44.9 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181166  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  47.92 
 
 
71 aa  48.1  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3384  twin arginine translocase protein A  52.38 
 
 
56 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3667  twin arginine-targeting protein translocase  52.63 
 
 
74 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02761  Sec-independent protein secretion pathway component  36.07 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.226319  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1611  twin-arginine translocation protein TatA/E  50 
 
 
69 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02885  hypothetical protein  58.93 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0596  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.79 
 
 
69 aa  47.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0621767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2251  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.82 
 
 
114 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.624721  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0702  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  58.33 
 
 
69 aa  47.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1503  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48.15 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.432776  hitchhiker  0.000608688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.74 
 
 
69 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.15 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.33 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1252  twin argininte translocase protein A  45.1 
 
 
63 aa  46.2  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1267  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.86 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2379  twin arginine-targeting protein translocase  48.94 
 
 
55 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329124  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.24 
 
 
207 aa  46.2  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.33 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.33 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0539  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03820  twin-arginine translocation protein, TatA subunit  37.93 
 
 
60 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>