136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1332 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1332  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  100 
 
 
77 aa  155  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2323  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.17 
 
 
63 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.405896  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4461  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  60.38 
 
 
66 aa  65.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.408951 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.39 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0024  sec-independent protein translocase  59.42 
 
 
71 aa  63.5  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3836  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  58.93 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.647162 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  44.44 
 
 
136 aa  60.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1459  sec-independent protein translocase  59.62 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0926084  normal  0.0392107 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1023  twin arginine-targeting protein translocase  50 
 
 
59 aa  60.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4498  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  58.33 
 
 
67 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0981  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  64.1 
 
 
66 aa  54.7  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.88 
 
 
87 aa  53.9  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  64.1 
 
 
74 aa  53.5  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  43.86 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1005  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  42 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  41.27 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1849  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.85 
 
 
69 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.37 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.34 
 
 
94 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  50 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.65 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  39.06 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  46.3 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  65.62 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2607  twin arginine-targeting protein translocase  45.65 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181166  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  42.31 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  45.28 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  40.35 
 
 
73 aa  48.1  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.38 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2436  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.66 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  40 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1748  twin-arginine translocation protein TatA/E  51.52 
 
 
69 aa  47.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4869  twin arginine-targeting protein translocase  45.65 
 
 
98 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.115935 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  38.98 
 
 
76 aa  47  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07460  Twin-arginine translocation protein TatA/E  40.91 
 
 
92 aa  47  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1343  Sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  47.17 
 
 
74 aa  47  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.139725 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2724  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.87 
 
 
90 aa  47  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.33 
 
 
88 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  43.64 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  44.9 
 
 
71 aa  46.2  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0666  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  31.34 
 
 
214 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0534  Sec-independent protein translocase TatA  48.78 
 
 
100 aa  47  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  34.69 
 
 
88 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  34.38 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0231  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.9 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.74798e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  39.62 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0292  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  46.51 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328055  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3667  twin arginine-targeting protein translocase  46.67 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0773  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  41.38 
 
 
68 aa  45.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0133448 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2500  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  58.82 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0191  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.16 
 
 
62 aa  45.4  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0104423  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2251  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.83 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.624721  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 
91 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 
91 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  38.1 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02885  hypothetical protein  73.08 
 
 
64 aa  45.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0395  twin arginine-targeting protein translocase  37.5 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0405  twin arginine-targeting protein translocase  37.5 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.019238  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0941  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.62 
 
 
55 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  32.26 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1003  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  46.15 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  38.89 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0539  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.39 
 
 
70 aa  44.7  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.58 
 
 
113 aa  45.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  50 
 
 
130 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0974  Sec-independent protein translocase TatA  44.26 
 
 
104 aa  44.7  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.450939  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  38.89 
 
 
88 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0942  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.75 
 
 
98 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1267  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.39 
 
 
80 aa  44.3  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  32.08 
 
 
103 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.67 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0917  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  48.98 
 
 
62 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3682  twin arginine-targeting protein translocase  44.07 
 
 
60 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000036766  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0596  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50.91 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0621767 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1278  Sec-independent protein translocase TatA  51.92 
 
 
73 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0109777  hitchhiker  0.00000252177 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  33.85 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  34.85 
 
 
87 aa  43.9  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  33.93 
 
 
84 aa  43.9  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1611  twin-arginine translocation protein TatA/E  50 
 
 
69 aa  43.5  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.42 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1332  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  54.05 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0472  twin arginine-targeting protein translocase  36.92 
 
 
81 aa  42.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0577  twin arginine-targeting protein translocase  50 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1677  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1649  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.25 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  37.1 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  34.33 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0702  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50.91 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.42 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2527  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  54.05 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.190921  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.42 
 
 
139 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2623  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  54.05 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1617  twin-arginine translocation protein TatA/E  30 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1209  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.28 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2379  twin arginine-targeting protein translocase  45.1 
 
 
55 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329124  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03291  hypothetical protein  30 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58964  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3376  twin arginine-targeting protein translocase  38.1 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0852423  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0997  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  47.62 
 
 
50 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2319  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.88 
 
 
103 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  40.43 
 
 
126 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  36.07 
 
 
207 aa  41.6  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>