213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0624 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0624  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  100 
 
 
70 aa  136  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.479059  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0702  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  86.36 
 
 
69 aa  89.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0577  twin arginine-targeting protein translocase  91.67 
 
 
65 aa  88.6  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1677  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0539  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  79.71 
 
 
70 aa  87  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1748  twin-arginine translocation protein TatA/E  74.29 
 
 
69 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1611  twin-arginine translocation protein TatA/E  85.25 
 
 
69 aa  78.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.347561 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0596  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  86.21 
 
 
69 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0621767 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1459  sec-independent protein translocase  53.57 
 
 
65 aa  67.4  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0926084  normal  0.0392107 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1660  twin arginine-targeting protein translocase  51.67 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4461  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50.88 
 
 
66 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.408951 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  68.89 
 
 
99 aa  64.7  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3836  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.1 
 
 
67 aa  62.8  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.647162 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.85 
 
 
140 aa  62.8  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2548  sec-independent protein translocase, protein  63.27 
 
 
130 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0910954  normal  0.655548 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2323  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  63.64 
 
 
63 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.405896  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1774  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  51.92 
 
 
115 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  53.12 
 
 
101 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.92 
 
 
92 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  54.9 
 
 
122 aa  60.5  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.21 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  54.24 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0226  twin arginine translocase protein A  46.15 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.332598 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  44.93 
 
 
103 aa  58.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03761  twin arginine translocase protein A  41.67 
 
 
88 aa  58.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.5386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  45.31 
 
 
88 aa  58.9  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0350  twin arginine translocase protein A  45.76 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  42.47 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  51.92 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  51.92 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  44.93 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0188  twin arginine-targeting protein translocase  48.21 
 
 
67 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623518  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.64 
 
 
122 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03771  twin arginine translocase protein A  43.06 
 
 
88 aa  57.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0534  Sec-independent protein translocase TatA  57.69 
 
 
100 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
87 aa  57  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.82 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1443  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  47.22 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.115776  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0990  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  43.64 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0122855  hitchhiker  0.000780107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1284  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  47.27 
 
 
104 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  46.15 
 
 
87 aa  55.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  43.64 
 
 
126 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1964  twin arginine-targeting protein translocase  60 
 
 
92 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.29 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1095  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50 
 
 
207 aa  55.5  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  47.83 
 
 
71 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02761  Sec-independent protein secretion pathway component  40 
 
 
83 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.226319  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2495  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  47.83 
 
 
113 aa  54.3  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0264  twin arginine translocase protein A  47.37 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4449  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 
90 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592928  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2080  twin arginine translocase protein A  47.37 
 
 
77 aa  53.9  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1005  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  48.98 
 
 
77 aa  53.9  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03820  twin-arginine translocation protein, TatA subunit  45 
 
 
60 aa  53.9  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  47.37 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2724  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46.77 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07460  Twin-arginine translocation protein TatA/E  42.86 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1807  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  41.18 
 
 
193 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.988739  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1079  twin arginine-targeting protein translocase  45.1 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000000000641532  normal  0.697921 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0941  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  55.81 
 
 
55 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1332  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  59.52 
 
 
71 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2527  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  59.52 
 
 
71 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.190921  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.17 
 
 
79 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.22 
 
 
152 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2623  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  59.52 
 
 
71 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0981  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  53.33 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0917  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50 
 
 
62 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.36 
 
 
74 aa  51.2  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  57.45 
 
 
73 aa  51.6  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2500  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.67 
 
 
94 aa  50.8  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  40.62 
 
 
84 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1519  twin arginine-targeting protein translocase  44.64 
 
 
89 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.085933  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2259  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38.81 
 
 
62 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000334335  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2436  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40 
 
 
81 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.38 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1987  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  38.1 
 
 
71 aa  50.4  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283995  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.38 
 
 
139 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  35.38 
 
 
139 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1252  twin argininte translocase protein A  52.08 
 
 
63 aa  50.4  0.000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4498  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.9 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  58.54 
 
 
59 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1063  Sec-independent protein translocase TatA  51.11 
 
 
60 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0562008 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  45.65 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.44 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  43.1 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  43.1 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  43.1 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_002936  DET1600  twin-arginine translocation protein TatB, putative  33.33 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0401964  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3045  Sec-independent protein translocase protein TatA  46.94 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0191  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.1 
 
 
62 aa  49.3  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0104423  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2684  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.41 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.388959  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0942  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.9 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1749  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.02 
 
 
58 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1725  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  51.02 
 
 
58 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  56.1 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  56.1 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  56.1 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  56.1 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  56.1 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4869  twin arginine-targeting protein translocase  42.86 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.115935 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  56.1 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>