More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1022 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1022  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  588  1e-167  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.88313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0664  hypothetical protein  65.33 
 
 		 330 aa  318  6e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.63 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  32.39 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  28.8 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  29.68 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  27.99 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  26.79 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  33.49 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  30.4 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  33.17 
 
 		 318 aa  105  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.25 
 
 		 313 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  29.56 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  28.14 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49940  DUF6 family membrane protein  30.23 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.363771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  33.16 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  32.73 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  29.55 
 
 		 305 aa  102  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  30.61 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  33.12 
 
 		 331 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  28.94 
 
 		 347 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.07 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  32.45 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  30.28 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38160  hypothetical protein  34.36 
 
 		 288 aa  99.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.863568  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  28.47 
 
 		 311 aa  99  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  30.27 
 
 		 295 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  29.6 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.58 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.53 
 
 		 322 aa  97.4  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  31.37 
 
 		 305 aa  96.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2606  hypothetical protein  28.57 
 
 		 293 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.134942  normal  0.0104554 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  35.06 
 
 		 308 aa  95.5  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  30.51 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  34.23 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.4 
 
 		 305 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  32.84 
 
 		 289 aa  93.2  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.79 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  28.42 
 
 		 320 aa  92.4  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.89 
 
 		 339 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  31.4 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  32.08 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  31.11 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  30.65 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2148  putative S-adenosylmethionine uptake transporter  31.28 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.820998 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.26 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1862  hypothetical protein  30.89 
 
 		 333 aa  90.5  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  33.47 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  30.84 
 
 		 295 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  33.47 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  30.24 
 
 		 318 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.37 
 
 		 316 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  29.55 
 
 		 285 aa  89.7  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  26.49 
 
 		 295 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  32.19 
 
 		 317 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  29 
 
 		 281 aa  89.4  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4025  hypothetical protein  37.24 
 
 		 274 aa  89.4  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651718  normal  0.814245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.85 
 
 		 289 aa  89  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  30.53 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  33.78 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1857  hypothetical protein  33.19 
 
 		 300 aa  89  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0328691  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  30.53 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  31.08 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  26.6 
 
 		 269 aa  88.2  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  27.07 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_002978  WD0621  hypothetical protein  25.68 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182424  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  31.96 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  31.1 
 
 		 294 aa  87.4  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  30.57 
 
 		 294 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  30.33 
 
 		 293 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  30.9 
 
 		 303 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  29.82 
 
 		 295 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2007  hypothetical protein  30.48 
 
 		 345 aa  87  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.21006  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.06 
 
 		 325 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  30.33 
 
 		 293 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  30.33 
 
 		 293 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  27.94 
 
 		 288 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  26.67 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  29.72 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4351  hypothetical protein  26.98 
 
 		 296 aa  85.9  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  32.33 
 
 		 295 aa  85.9  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0342218 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  29 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  33.2 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  31.12 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.9 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  28.51 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  26.55 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3275  hypothetical protein  30.95 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  27.21 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  30.48 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0229  hypothetical protein  29.06 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  28.41 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  30.47 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  28.63 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  28.77 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.07 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0156  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>