124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1796 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1796  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
423 aa  815    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3581  protein of unknown function DUF214  62.92 
 
 
451 aa  479  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1214  protein of unknown function DUF214  48.04 
 
 
422 aa  319  6e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2994  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  28.09 
 
 
417 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1213  protein of unknown function DUF214  28.26 
 
 
411 aa  64.7  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.72 
 
 
420 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.65 
 
 
408 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.25 
 
 
411 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2748  putative lipoprotein releasing system transmembrane  26.45 
 
 
418 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1210  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.16 
 
 
418 aa  58.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2398  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.28 
 
 
418 aa  57  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2109  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  25.31 
 
 
416 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1632  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.62 
 
 
410 aa  56.2  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000222973  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  22.22 
 
 
386 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3582  protein of unknown function DUF214  26.27 
 
 
410 aa  55.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.41 
 
 
411 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.14 
 
 
414 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  25.14 
 
 
414 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  31.03 
 
 
855 aa  53.9  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1761  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.18 
 
 
414 aa  53.9  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1765  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.86 
 
 
413 aa  53.9  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.157209  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3232  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.15 
 
 
418 aa  53.5  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215903  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1904  hypothetical protein  25.31 
 
 
416 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.745747  hitchhiker  0.00175073 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  26.27 
 
 
852 aa  53.5  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  29.38 
 
 
873 aa  53.1  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2201  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family protein  21.28 
 
 
413 aa  52.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.93 
 
 
424 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0960  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.63 
 
 
416 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.0249332 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  30.69 
 
 
825 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  24.21 
 
 
423 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1117  lipoprotein releasing system transmembrane  27.14 
 
 
416 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0172186  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3231  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26 
 
 
422 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113164  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5136  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26 
 
 
422 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433144  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1252  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.96 
 
 
414 aa  52.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.368874  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2831  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.83 
 
 
416 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0414508  hitchhiker  0.00948545 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1545  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.68 
 
 
407 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0135691  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  23.37 
 
 
389 aa  51.6  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1056  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.35 
 
 
416 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.530836  normal  0.504254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3588  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.64 
 
 
416 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.488659 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1046  lipoprotein releasing system transmembrane protein  25.19 
 
 
414 aa  51.2  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0938  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.19 
 
 
414 aa  51.2  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2477  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolC  23.51 
 
 
400 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.312785  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  23.97 
 
 
386 aa  50.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2836  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.77 
 
 
415 aa  50.4  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.620052  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3316  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.73 
 
 
461 aa  50.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3700  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.45 
 
 
417 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.8164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2346  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.53 
 
 
416 aa  50.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323587  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0694  lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.54 
 
 
402 aa  50.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.361116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  22.61 
 
 
850 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  22.61 
 
 
794 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  39.45 
 
 
828 aa  50.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1813  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.87 
 
 
416 aa  50.1  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0198484  normal  0.092514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  28.86 
 
 
836 aa  50.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5401  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.06 
 
 
423 aa  49.7  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117898  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  24.37 
 
 
386 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2154  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.35 
 
 
416 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0219351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.18 
 
 
422 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.998701  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1695  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.64 
 
 
416 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0851802 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5146  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.5 
 
 
417 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1986  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.55 
 
 
418 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.914701  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2509  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.23 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418191  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.78 
 
 
416 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1747  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.83 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1618  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolC  23.58 
 
 
400 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1671  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.64 
 
 
416 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.966628  normal  0.962664 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0507  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26 
 
 
427 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1040  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.09 
 
 
416 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.678846 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2233  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.25 
 
 
409 aa  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  28.26 
 
 
846 aa  47.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0940  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.99 
 
 
415 aa  47  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  32.52 
 
 
404 aa  46.6  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.69 
 
 
416 aa  46.6  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4462  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.22 
 
 
447 aa  46.6  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1648  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolC  22.33 
 
 
401 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3567  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.01 
 
 
423 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.756596  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1631  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolC  22.4 
 
 
399 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0156966  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1607  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.67 
 
 
415 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.345047  normal  0.129769 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1600  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolC  22.15 
 
 
400 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000642321  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2863  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolC  22.15 
 
 
400 aa  46.6  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0147192  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1707  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolC  22.15 
 
 
400 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104309  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.44 
 
 
420 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2211  hypothetical protein  22.82 
 
 
415 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0065  ABC transporter permease  27.91 
 
 
772 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25 
 
 
423 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3383  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.5 
 
 
409 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  26.39 
 
 
791 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  28.12 
 
 
488 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  28.19 
 
 
835 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  26.63 
 
 
849 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.17 
 
 
416 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  24.55 
 
 
386 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2257  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  24.64 
 
 
410 aa  44.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2239  hypothetical protein  22.41 
 
 
415 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3857  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.98 
 
 
414 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0641909  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1079  hypothetical protein  28.51 
 
 
655 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  25.64 
 
 
847 aa  45.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  21.68 
 
 
386 aa  45.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1634  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.95 
 
 
417 aa  44.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0870078  normal  0.876319 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  27.27 
 
 
861 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2978  hypothetical protein  34.26 
 
 
419 aa  45.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231225  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>