More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2034 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2947  serine hydroxymethyltransferase  78.8 
 
 		 416 aa  663    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.106017  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1701  Glycine hydroxymethyltransferase  77.86 
 
 		 408 aa  643    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2216  serine hydroxymethyltransferase  76.57 
 
 		 424 aa  638    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3305  Glycine hydroxymethyltransferase  76.39 
 
 		 417 aa  647    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2034  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 415 aa  837    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0609471  normal  0.358704 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4145  Glycine hydroxymethyltransferase  66.67 
 
 		 416 aa  541  1e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.021739  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4749  Glycine hydroxymethyltransferase  66.67 
 
 		 416 aa  535  1e-151  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.081804  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2892  serine hydroxymethyltransferase  61.67 
 
 		 414 aa  507  9.999999999999999e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2245  serine hydroxymethyltransferase  63.05 
 
 		 414 aa  498  1e-140  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0745  serine hydroxymethyltransferase  56.16 
 
 		 415 aa  479  1e-134  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  54.5 
 
 		 414 aa  473  1e-132  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  53.86 
 
 		 410 aa  474  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  56.05 
 
 		 416 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  53.62 
 
 		 410 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2187  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 417 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.911574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  55.77 
 
 		 420 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  56.16 
 
 		 412 aa  463  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  54.15 
 
 		 415 aa  461  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  55.5 
 
 		 415 aa  462  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  53.94 
 
 		 414 aa  463  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  54.13 
 
 		 414 aa  460  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  53.28 
 
 		 412 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  53.9 
 
 		 412 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  53.53 
 
 		 412 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  53.53 
 
 		 412 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  55.91 
 
 		 413 aa  458  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  55.31 
 
 		 415 aa  454  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  54.11 
 
 		 413 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  54.68 
 
 		 411 aa  454  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  53.04 
 
 		 413 aa  455  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  54.61 
 
 		 415 aa  456  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  52.8 
 
 		 413 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  52.8 
 
 		 413 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  52.8 
 
 		 414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  52.8 
 
 		 414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  52.8 
 
 		 414 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  55.31 
 
 		 415 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  52.8 
 
 		 413 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  55.56 
 
 		 415 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  52.8 
 
 		 413 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  53.06 
 
 		 412 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  55.56 
 
 		 415 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  52.8 
 
 		 413 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4027  glycine hydroxymethyltransferase  52.64 
 
 		 421 aa  451  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17117  normal  0.0123375 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  52.44 
 
 		 413 aa  448  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  53.55 
 
 		 418 aa  451  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  53.98 
 
 		 416 aa  449  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  54.57 
 
 		 415 aa  448  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  53.16 
 
 		 419 aa  449  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  52.55 
 
 		 413 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  52.53 
 
 		 413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  55.77 
 
 		 429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  55.75 
 
 		 431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  51.45 
 
 		 423 aa  448  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  51.45 
 
 		 423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  51.84 
 
 		 413 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0577  serine hydroxymethyltransferase  51.46 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  51.21 
 
 		 412 aa  443  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  54.26 
 
 		 417 aa  443  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  53.17 
 
 		 412 aa  444  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  50.97 
 
 		 423 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0436  serine hydroxymethyltransferase  52.57 
 
 		 415 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  51.71 
 
 		 412 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21550  serine hydroxymethyltransferase  53.01 
 
 		 418 aa  439  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.968894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1580  serine hydroxymethyltransferase  51.21 
 
 		 419 aa  440  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540119  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  52.08 
 
 		 411 aa  438  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  50.72 
 
 		 423 aa  438  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  52.68 
 
 		 417 aa  441  9.999999999999999e-123  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  53.12 
 
 		 417 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  54.88 
 
 		 417 aa  437  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  50.61 
 
 		 416 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_378  serine hydroxymethyltransferase  52.81 
 
 		 415 aa  437  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  53.04 
 
 		 413 aa  436  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  52.08 
 
 		 411 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  52.21 
 
 		 419 aa  437  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  51.44 
 
 		 422 aa  436  1e-121  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1833  serine hydroxymethyltransferase  53.27 
 
 		 423 aa  435  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.785323  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0023  serine hydroxymethyltransferase  53.14 
 
 		 436 aa  436  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  51.71 
 
 		 422 aa  438  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  52.83 
 
 		 416 aa  435  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0413  serine hydroxymethyltransferase  53.41 
 
 		 415 aa  437  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.774669  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1356  serine hydroxymethyltransferase  53.09 
 
 		 416 aa  436  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0821973  hitchhiker  0.0000000382903 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  52.78 
 
 		 417 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  51.31 
 
 		 424 aa  435  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  51.92 
 
 		 419 aa  432  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  52.94 
 
 		 424 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  50.36 
 
 		 420 aa  432  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  52.58 
 
 		 417 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  53.19 
 
 		 415 aa  432  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1649  serine hydroxymethyltransferase  53.45 
 
 		 434 aa  432  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  51.09 
 
 		 417 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  51.33 
 
 		 417 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  51.09 
 
 		 417 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  51.33 
 
 		 417 aa  433  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2477  serine hydroxymethyltransferase  49.16 
 
 		 417 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  51.09 
 
 		 417 aa  431  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  50.85 
 
 		 417 aa  431  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  52.03 
 
 		 427 aa  429  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  50.85 
 
 		 417 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0417  serine hydroxymethyltransferase  50.49 
 
 		 420 aa  428  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>