More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2892 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2892  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 414 aa  838    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2245  serine hydroxymethyltransferase  73.61 
 
 		 414 aa  592  1e-168  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3305  Glycine hydroxymethyltransferase  64.13 
 
 		 417 aa  523  1e-147  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2947  serine hydroxymethyltransferase  61.58 
 
 		 416 aa  512  1e-144  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.106017  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1701  Glycine hydroxymethyltransferase  64.21 
 
 		 408 aa  509  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2216  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 		 424 aa  504  1e-141  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4145  Glycine hydroxymethyltransferase  60.68 
 
 		 416 aa  495  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.021739  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2034  serine hydroxymethyltransferase  61.67 
 
 		 415 aa  492  9.999999999999999e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0609471  normal  0.358704 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4749  Glycine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 416 aa  482  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.081804  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  54.15 
 
 		 429 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  54.01 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  53.16 
 
 		 419 aa  430  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  51.83 
 
 		 413 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  50 
 
 		 423 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  49.76 
 
 		 423 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  50.12 
 
 		 413 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1660  serine hydroxymethyltransferase  51.7 
 
 		 418 aa  421  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479076  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  51.85 
 
 		 417 aa  420  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  52.08 
 
 		 438 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  49.27 
 
 		 423 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  49.51 
 
 		 423 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  48.54 
 
 		 412 aa  418  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  50.37 
 
 		 420 aa  419  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  53.3 
 
 		 417 aa  419  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  52.44 
 
 		 413 aa  418  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  49.51 
 
 		 411 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  50.74 
 
 		 425 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0745  serine hydroxymethyltransferase  50.49 
 
 		 415 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  50.61 
 
 		 416 aa  418  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  51.58 
 
 		 417 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  50.74 
 
 		 425 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  51.84 
 
 		 416 aa  415  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  51.34 
 
 		 415 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  50.61 
 
 		 414 aa  416  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  51.22 
 
 		 424 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  50.86 
 
 		 415 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  49.39 
 
 		 415 aa  414  1e-114  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0436  serine hydroxymethyltransferase  51.34 
 
 		 415 aa  412  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  52.54 
 
 		 415 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  51.85 
 
 		 414 aa  413  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  50.37 
 
 		 415 aa  413  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  51.85 
 
 		 414 aa  413  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  49.26 
 
 		 411 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  51.83 
 
 		 415 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  52.18 
 
 		 417 aa  413  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2187  serine hydroxymethyltransferase  50.86 
 
 		 417 aa  412  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.911574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  51.34 
 
 		 415 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  49.88 
 
 		 414 aa  412  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  50.24 
 
 		 412 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  50.24 
 
 		 412 aa  413  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  51.84 
 
 		 417 aa  409  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  50.12 
 
 		 418 aa  409  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0461  serine hydroxymethyltransferase  50.12 
 
 		 417 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  49.39 
 
 		 416 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_378  serine hydroxymethyltransferase  51.1 
 
 		 415 aa  409  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5208  serine hydroxymethyltransferase  50.12 
 
 		 417 aa  411  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287253 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  49.02 
 
 		 417 aa  410  1e-113  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  49.51 
 
 		 416 aa  408  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  50.49 
 
 		 413 aa  409  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  48.05 
 
 		 414 aa  409  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  48.29 
 
 		 427 aa  408  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  50.37 
 
 		 410 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  49.75 
 
 		 415 aa  409  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  50 
 
 		 415 aa  410  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  50.86 
 
 		 415 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  50.25 
 
 		 417 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  50 
 
 		 417 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0322  serine hydroxymethyltransferase  50.12 
 
 		 417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457346  decreased coverage  0.0000286459 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  50.12 
 
 		 412 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  50 
 
 		 417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  50 
 
 		 419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  50.12 
 
 		 415 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0344  serine hydroxymethyltransferase  50.12 
 
 		 417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4712  serine hydroxymethyltransferase  49.88 
 
 		 417 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6203  serine hydroxymethyltransferase  50.86 
 
 		 417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0377267  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  50.12 
 
 		 413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2076  serine hydroxymethyltransferase  50.98 
 
 		 427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.745833  hitchhiker  0.000706319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  50.74 
 
 		 419 aa  408  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  50.74 
 
 		 427 aa  406  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0413  serine hydroxymethyltransferase  51.1 
 
 		 415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.774669  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0577  serine hydroxymethyltransferase  49.76 
 
 		 419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0345  serine hydroxymethyltransferase  50.12 
 
 		 417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.911009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4885  serine hydroxymethyltransferase  50.12 
 
 		 417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.994809  normal  0.551008 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  50.62 
 
 		 411 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  50.37 
 
 		 412 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  50.36 
 
 		 416 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  49.88 
 
 		 410 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  50.12 
 
 		 417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71460  serine hydroxymethyltransferase  50.86 
 
 		 417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3262  serine hydroxymethyltransferase  48.64 
 
 		 454 aa  401  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  49.38 
 
 		 413 aa  403  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  48.91 
 
 		 414 aa  403  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  48.91 
 
 		 414 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  48.05 
 
 		 412 aa  403  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2027  glycine hydroxymethyltransferase  51.09 
 
 		 417 aa  404  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  48.17 
 
 		 412 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4132  serine hydroxymethyltransferase  48.66 
 
 		 417 aa  403  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000588766  normal  0.517769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  50.49 
 
 		 417 aa  402  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3468  serine hydroxymethyltransferase  51.46 
 
 		 418 aa  402  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  50 
 
 		 417 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>