More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1701 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2216  serine hydroxymethyltransferase  77.75 
 
 		 424 aa  641    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1701  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 408 aa  826    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3305  Glycine hydroxymethyltransferase  89.03 
 
 		 417 aa  737    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2947  serine hydroxymethyltransferase  78.61 
 
 		 416 aa  649    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.106017  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2034  serine hydroxymethyltransferase  79.27 
 
 		 415 aa  623  1e-177  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0609471  normal  0.358704 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4145  Glycine hydroxymethyltransferase  68.43 
 
 		 416 aa  532  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.021739  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4749  Glycine hydroxymethyltransferase  68.8 
 
 		 416 aa  530  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.081804  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2892  serine hydroxymethyltransferase  64.21 
 
 		 414 aa  509  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2245  serine hydroxymethyltransferase  64.32 
 
 		 414 aa  497  1e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0745  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 		 415 aa  474  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 414 aa  474  1e-132  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  58.79 
 
 		 412 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  56.46 
 
 		 420 aa  461  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  58.42 
 
 		 415 aa  461  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  56.82 
 
 		 414 aa  462  1e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  56.39 
 
 		 412 aa  462  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  56.25 
 
 		 416 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  57.59 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  57.91 
 
 		 415 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  57.03 
 
 		 410 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  56.77 
 
 		 410 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  54.89 
 
 		 413 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  55.14 
 
 		 414 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  55.14 
 
 		 414 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  54.89 
 
 		 414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  55.14 
 
 		 413 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  56.06 
 
 		 414 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4027  glycine hydroxymethyltransferase  56.35 
 
 		 421 aa  452  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17117  normal  0.0123375 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  55.14 
 
 		 413 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  54.89 
 
 		 413 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  56.06 
 
 		 414 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  54.64 
 
 		 413 aa  450  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  54.87 
 
 		 414 aa  449  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  56.63 
 
 		 415 aa  450  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  54.89 
 
 		 413 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2187  serine hydroxymethyltransferase  56.17 
 
 		 417 aa  451  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.911574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 413 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  56.38 
 
 		 415 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3468  serine hydroxymethyltransferase  56.42 
 
 		 418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  55.73 
 
 		 411 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  54.59 
 
 		 412 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  53.98 
 
 		 413 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  54.8 
 
 		 413 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  55.84 
 
 		 419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  57.18 
 
 		 413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  54.8 
 
 		 418 aa  444  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  54.27 
 
 		 413 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  56.11 
 
 		 416 aa  442  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0023  serine hydroxymethyltransferase  54.98 
 
 		 436 aa  442  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  55 
 
 		 412 aa  442  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  54.14 
 
 		 419 aa  442  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  54.27 
 
 		 420 aa  442  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  56.38 
 
 		 415 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  53.27 
 
 		 412 aa  438  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  53.27 
 
 		 412 aa  438  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21550  serine hydroxymethyltransferase  54.43 
 
 		 418 aa  440  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.968894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1833  serine hydroxymethyltransferase  56.22 
 
 		 423 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.785323  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1649  serine hydroxymethyltransferase  56.36 
 
 		 434 aa  440  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  54.75 
 
 		 415 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  53.38 
 
 		 422 aa  437  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  55.27 
 
 		 415 aa  435  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  53.75 
 
 		 417 aa  436  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  53.5 
 
 		 417 aa  435  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  55.47 
 
 		 412 aa  435  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  53.09 
 
 		 417 aa  435  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  52.88 
 
 		 417 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  53.55 
 
 		 416 aa  433  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  52.76 
 
 		 412 aa  433  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  52.25 
 
 		 417 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3638  serine hydroxymethyltransferase  52.59 
 
 		 417 aa  432  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1630  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  56.2 
 
 		 566 aa  433  1e-120  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1356  serine hydroxymethyltransferase  54.71 
 
 		 416 aa  431  1e-120  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0821973  hitchhiker  0.0000000382903 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  53.09 
 
 		 417 aa  434  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  50.87 
 
 		 412 aa  434  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1912  serine hydroxymethyltransferase  54.29 
 
 		 430 aa  433  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  52.25 
 
 		 417 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  52.5 
 
 		 417 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  56.64 
 
 		 417 aa  433  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  51 
 
 		 415 aa  433  1e-120  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0256  serine hydroxymethyltransferase  52.87 
 
 		 411 aa  434  1e-120  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.666958 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  52.5 
 
 		 417 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1265  serine hydroxymethyltransferase  52.37 
 
 		 417 aa  430  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000077829  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  51.75 
 
 		 417 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  51.75 
 
 		 417 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  53.71 
 
 		 417 aa  431  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  52.22 
 
 		 417 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  52.84 
 
 		 417 aa  428  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  51.75 
 
 		 417 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  52.22 
 
 		 417 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2432  serine hydroxymethyltransferase  57.68 
 
 		 412 aa  428  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139104  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  51.75 
 
 		 417 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  55.21 
 
 		 417 aa  430  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  55.24 
 
 		 412 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  51.75 
 
 		 417 aa  431  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  53.87 
 
 		 413 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1851  serine hydroxymethyltransferase  54.04 
 
 		 417 aa  430  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0445  serine hydroxymethyltransferase  52.37 
 
 		 417 aa  430  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000471586  hitchhiker  0.0000012571 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1158  serine hydroxymethyltransferase  52.37 
 
 		 417 aa  430  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000444868  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0788  serine hydroxymethyltransferase  52.53 
 
 		 410 aa  429  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0984915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>