More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4145 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_4145  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 416 aa  844    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.021739  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4749  Glycine hydroxymethyltransferase  75.42 
 
 		 416 aa  610  1e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.081804  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2216  serine hydroxymethyltransferase  71.22 
 
 		 424 aa  590  1e-167  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2947  serine hydroxymethyltransferase  69.57 
 
 		 416 aa  588  1e-167  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.106017  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3305  Glycine hydroxymethyltransferase  68.36 
 
 		 417 aa  585  1e-166  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1701  Glycine hydroxymethyltransferase  68.96 
 
 		 408 aa  555  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2034  serine hydroxymethyltransferase  66.67 
 
 		 415 aa  543  1e-153  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0609471  normal  0.358704 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2892  serine hydroxymethyltransferase  60.68 
 
 		 414 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  58.5 
 
 		 416 aa  498  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  58.74 
 
 		 413 aa  498  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  58.64 
 
 		 415 aa  495  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  58.39 
 
 		 415 aa  488  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  58.39 
 
 		 415 aa  487  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2245  serine hydroxymethyltransferase  59.12 
 
 		 414 aa  485  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  58.39 
 
 		 415 aa  486  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 411 aa  487  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  56.97 
 
 		 420 aa  488  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  57.66 
 
 		 415 aa  483  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  57.77 
 
 		 418 aa  483  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  56.45 
 
 		 412 aa  481  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  56.45 
 
 		 412 aa  481  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  57 
 
 		 415 aa  479  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  56.83 
 
 		 419 aa  479  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  55.18 
 
 		 413 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  56.72 
 
 		 414 aa  478  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 		 422 aa  477  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 413 aa  476  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 413 aa  475  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 414 aa  475  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 414 aa  475  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 414 aa  475  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  56.59 
 
 		 412 aa  475  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 413 aa  476  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  56.1 
 
 		 413 aa  477  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  56.69 
 
 		 415 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 413 aa  475  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 413 aa  475  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  56.45 
 
 		 413 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0745  serine hydroxymethyltransferase  56.55 
 
 		 415 aa  475  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  55.72 
 
 		 413 aa  474  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  55.1 
 
 		 412 aa  473  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  56.79 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4027  glycine hydroxymethyltransferase  54.92 
 
 		 421 aa  474  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17117  normal  0.0123375 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  54.99 
 
 		 417 aa  474  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  54.63 
 
 		 410 aa  474  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  55.12 
 
 		 413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 410 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  54.78 
 
 		 417 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  54.59 
 
 		 413 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  54.77 
 
 		 415 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2187  serine hydroxymethyltransferase  55.72 
 
 		 417 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.911574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3895  serine hydroxymethyltransferase  55.47 
 
 		 415 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  55.18 
 
 		 412 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  54.94 
 
 		 414 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  54.5 
 
 		 415 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  54.37 
 
 		 414 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  54.94 
 
 		 414 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  54.55 
 
 		 417 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 412 aa  463  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  54.94 
 
 		 438 aa  464  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4712  serine hydroxymethyltransferase  53.24 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  54.13 
 
 		 412 aa  462  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  53.06 
 
 		 412 aa  461  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3262  serine hydroxymethyltransferase  53.64 
 
 		 454 aa  463  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2449  serine hydroxymethyltransferase  55.23 
 
 		 415 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0765  serine hydroxymethyltransferase  54.99 
 
 		 415 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186767  normal  0.156833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  53.83 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71460  serine hydroxymethyltransferase  54.68 
 
 		 417 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  53.83 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  53.59 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  53.35 
 
 		 417 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  53.35 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0461  serine hydroxymethyltransferase  53 
 
 		 417 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  54.01 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3363  serine hydroxymethyltransferase  55.34 
 
 		 415 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  54.01 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6203  serine hydroxymethyltransferase  54.2 
 
 		 417 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0377267  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2754  serine hydroxymethyltransferase  55.1 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  53.59 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3468  serine hydroxymethyltransferase  56.37 
 
 		 418 aa  459  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  54.01 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  54.26 
 
 		 415 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  53.48 
 
 		 416 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1917  serine hydroxymethyltransferase  52.05 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.584505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  53.35 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4132  serine hydroxymethyltransferase  53.48 
 
 		 417 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000588766  normal  0.517769 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  54.92 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  53.3 
 
 		 420 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  54.5 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  54.01 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  53.59 
 
 		 417 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  53.59 
 
 		 417 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  55.23 
 
 		 431 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5200  serine hydroxymethyltransferase  54.96 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  54.5 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  53.77 
 
 		 414 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  55.47 
 
 		 431 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  54.01 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  54.01 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  54.01 
 
 		 415 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>