More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4749 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013745  Htur_4749  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 416 aa  847    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.081804  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4145  Glycine hydroxymethyltransferase  75.42 
 
 		 416 aa  610  1e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.021739  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3305  Glycine hydroxymethyltransferase  69.59 
 
 		 417 aa  589  1e-167  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2947  serine hydroxymethyltransferase  68.2 
 
 		 416 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.106017  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2216  serine hydroxymethyltransferase  69.27 
 
 		 424 aa  577  1e-164  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1701  Glycine hydroxymethyltransferase  68.8 
 
 		 408 aa  555  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2034  serine hydroxymethyltransferase  66.67 
 
 		 415 aa  536  1e-151  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0609471  normal  0.358704 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2892  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 414 aa  503  1e-141  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  58.74 
 
 		 416 aa  501  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 		 415 aa  495  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 415 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 415 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  56.39 
 
 		 415 aa  489  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  57.66 
 
 		 414 aa  489  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  59.41 
 
 		 415 aa  490  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  59.41 
 
 		 413 aa  491  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 420 aa  487  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 415 aa  487  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  58.92 
 
 		 415 aa  487  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 412 aa  484  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  55.93 
 
 		 413 aa  482  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  55.8 
 
 		 415 aa  478  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  56.23 
 
 		 413 aa  479  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  56.23 
 
 		 413 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  55.99 
 
 		 413 aa  478  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  55.99 
 
 		 414 aa  478  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  56.23 
 
 		 414 aa  480  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  57.46 
 
 		 411 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 		 422 aa  481  1e-134  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  56.23 
 
 		 413 aa  478  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  54.28 
 
 		 414 aa  479  1e-134  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  55.99 
 
 		 412 aa  475  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  55.99 
 
 		 414 aa  478  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  55.99 
 
 		 413 aa  476  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2245  serine hydroxymethyltransferase  59.66 
 
 		 414 aa  476  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  55.99 
 
 		 413 aa  478  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  55.75 
 
 		 413 aa  476  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  56.48 
 
 		 412 aa  478  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  55.74 
 
 		 424 aa  474  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  54.01 
 
 		 412 aa  471  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  55.5 
 
 		 418 aa  473  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  55.26 
 
 		 413 aa  471  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 410 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  55.83 
 
 		 419 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  54.03 
 
 		 413 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  55.42 
 
 		 417 aa  465  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  55.42 
 
 		 417 aa  464  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  55.53 
 
 		 431 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  55.15 
 
 		 416 aa  464  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  55.75 
 
 		 417 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  54.99 
 
 		 414 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  55.12 
 
 		 410 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  52.53 
 
 		 413 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  54.99 
 
 		 414 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0745  serine hydroxymethyltransferase  55.12 
 
 		 415 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  53.41 
 
 		 412 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 412 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  54.48 
 
 		 417 aa  463  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  55.18 
 
 		 417 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0417  serine hydroxymethyltransferase  53.72 
 
 		 420 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  54.81 
 
 		 412 aa  461  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  55.53 
 
 		 412 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  54.26 
 
 		 418 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  54.15 
 
 		 412 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  54.81 
 
 		 412 aa  461  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0790  serine hydroxymethyltransferase  53.03 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  54.15 
 
 		 419 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  54.33 
 
 		 429 aa  458  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0678  serine hydroxymethyltransferase  53.27 
 
 		 415 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.478588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0722  serine hydroxymethyltransferase  53.03 
 
 		 436 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.142236 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  56.3 
 
 		 412 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  53.16 
 
 		 415 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  53.77 
 
 		 508 aa  459  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  54.52 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  55.23 
 
 		 417 aa  461  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  53.79 
 
 		 414 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  54.03 
 
 		 422 aa  458  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  54.9 
 
 		 417 aa  454  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0729  serine hydroxymethyltransferase  52.78 
 
 		 415 aa  456  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  52.7 
 
 		 411 aa  455  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1917  serine hydroxymethyltransferase  51.94 
 
 		 430 aa  458  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.584505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4027  glycine hydroxymethyltransferase  54.99 
 
 		 421 aa  455  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17117  normal  0.0123375 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  55.75 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  54.46 
 
 		 438 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3468  serine hydroxymethyltransferase  56.37 
 
 		 418 aa  456  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2449  serine hydroxymethyltransferase  53.64 
 
 		 415 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0765  serine hydroxymethyltransferase  53.16 
 
 		 415 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186767  normal  0.156833 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  53.53 
 
 		 424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  54.22 
 
 		 417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  53.28 
 
 		 415 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  52.7 
 
 		 411 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  53.37 
 
 		 417 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  55.12 
 
 		 427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  54 
 
 		 417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1649  serine hydroxymethyltransferase  55.39 
 
 		 434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  53.3 
 
 		 412 aa  448  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3274  serine hydroxymethyltransferase  53.03 
 
 		 412 aa  449  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000462006  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0075  serine hydroxymethyltransferase  51.11 
 
 		 413 aa  448  1e-125  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  54.26 
 
 		 416 aa  448  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  51.94 
 
 		 415 aa  448  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>