More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0073 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0073  ammonium Transporter Family  100 
 
 		 592 aa  1185    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00320699 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1236  ammonia permease  52.75 
 
 		 431 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1162  ammonium transporter  43.69 
 
 		 438 aa  163  6e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.317935  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1465  ammonium transporter  43.6 
 
 		 435 aa  163  9e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2547  ammonium transporter  41.31 
 
 		 434 aa  160  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916988  normal  0.19301 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0980  ammonium transporter  42.18 
 
 		 424 aa  152  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1936  ammonium transporter  39.32 
 
 		 446 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1956  ammonium transporter  39.32 
 
 		 446 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.77872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2002  ammonium transporter  39.32 
 
 		 446 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.490754  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  39.45 
 
 		 442 aa  151  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  40.78 
 
 		 441 aa  151  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  40.48 
 
 		 474 aa  149  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  38.97 
 
 		 450 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4185  ammonium transporter  38.03 
 
 		 450 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.306123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8000  ammonium transporter  37.5 
 
 		 466 aa  144  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2492  ammonium transporter  40.61 
 
 		 450 aa  144  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.262408  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  29.21 
 
 		 433 aa  143  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2232  ammonium transporter  41.62 
 
 		 451 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000018516 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3530  ammonium transporter  40.45 
 
 		 443 aa  140  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3149  ammonium transporter  36.73 
 
 		 459 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000753064  hitchhiker  0.00186594 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0749  ammonium transporter  27.45 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000261873  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  38.89 
 
 		 432 aa  139  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2078  ammonium transporter  38.97 
 
 		 450 aa  139  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.026274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4812  ammonium transporter  35.25 
 
 		 465 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  25.82 
 
 		 405 aa  134  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3244  ammonium transporter  35.16 
 
 		 457 aa  133  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  36.94 
 
 		 439 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12934  ammonium-transport integral membrane protein amt  38.36 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.90633e-27  normal  0.349751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2242  ammonium transporter  40.22 
 
 		 438 aa  130  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0898942  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4015  ammonium transporter  37.04 
 
 		 456 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  37.27 
 
 		 427 aa  128  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2272  ammonium transporter  27.11 
 
 		 467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.220314  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1656  Rh family protein/ammonium transporter  28.85 
 
 		 498 aa  127  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  36.62 
 
 		 515 aa  126  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  36.92 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3269  ammonium transporter  37.24 
 
 		 441 aa  125  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1785  ammonium transporter  41.67 
 
 		 439 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  36.62 
 
 		 515 aa  125  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  38.94 
 
 		 431 aa  124  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  37.96 
 
 		 456 aa  124  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  39.34 
 
 		 438 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  37.17 
 
 		 446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  35.55 
 
 		 405 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1393  ammonium transporter  36.36 
 
 		 445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218958  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1187  ammonium transporter  37.04 
 
 		 478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.569583  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  38.68 
 
 		 429 aa  121  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5934  ammonium transporter  34.05 
 
 		 447 aa  121  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80204  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  35.94 
 
 		 434 aa  120  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  38.32 
 
 		 489 aa  120  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  27.94 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0968  ammonium transporter  35.45 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96365  normal  0.13962 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  36.04 
 
 		 485 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  37.04 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  38.54 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3427  ammonium transporter  38.46 
 
 		 433 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000283627  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  36.06 
 
 		 464 aa  118  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  35.14 
 
 		 488 aa  118  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0776  ammonia permease  35.47 
 
 		 398 aa  118  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  36.27 
 
 		 428 aa  118  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  34.44 
 
 		 454 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  34.67 
 
 		 461 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5072  ammonium transporter  35.87 
 
 		 440 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2907  ammonium transporter  41.79 
 
 		 442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  37.02 
 
 		 408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04231  hypothetical protein  35.44 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09130  ammonium transporter  39.34 
 
 		 420 aa  115  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.471834  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  33.33 
 
 		 494 aa  115  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  32.88 
 
 		 410 aa  115  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  35.65 
 
 		 507 aa  115  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  37.02 
 
 		 408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  36.24 
 
 		 431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  35.59 
 
 		 496 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  34.58 
 
 		 410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  36.87 
 
 		 467 aa  113  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31514  Amt family transporter: ammonium  37.7 
 
 		 418 aa  113  9e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  37.02 
 
 		 408 aa  113  9e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  34.11 
 
 		 410 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  34.91 
 
 		 410 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  32.86 
 
 		 457 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0213  ammonium transporter  25.89 
 
 		 520 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1699  ammonia permease  34.17 
 
 		 413 aa  113  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000279978  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0212  ammonium transporter  34.72 
 
 		 507 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  34.27 
 
 		 411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  34.11 
 
 		 410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  34.11 
 
 		 410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  34.08 
 
 		 442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  34.72 
 
 		 405 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  36.49 
 
 		 451 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  27.47 
 
 		 443 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  35.45 
 
 		 442 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0164  ammonium transporter  34.93 
 
 		 475 aa  111  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.611454 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  33.64 
 
 		 410 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07463  Ammonium transporter MEAAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8TFN9]  27.09 
 
 		 544 aa  110  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279832  normal  0.0848896 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  38.5 
 
 		 434 aa  110  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0014  ammonium transporter  32.88 
 
 		 455 aa  111  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0504  ammonium transporter  37.14 
 
 		 428 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0177698  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0111  ammonium transporter  35.35 
 
 		 476 aa  110  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0168687 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  35.35 
 
 		 444 aa  110  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  34.23 
 
 		 453 aa  110  8.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  33.64 
 
 		 410 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>