275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1658 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1658  radical SAM family protein  100 
 
 		 250 aa  510  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021  normal  0.87771 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1721  radical SAM domain-containing protein  74.8 
 
 		 250 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0587139  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2122  radical SAM domain-containing protein  63.6 
 
 		 250 aa  350  8.999999999999999e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2965  Radical SAM domain protein  59.35 
 
 		 251 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1318  Radical SAM domain protein  58.13 
 
 		 251 aa  304  7e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.11039  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1846  Radical SAM domain protein  48.56 
 
 		 254 aa  253  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260546  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1785  radical SAM domain-containing protein  48.77 
 
 		 249 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1757  radical SAM domain-containing protein  44.72 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1642  organic radical activating enzymes  44.08 
 
 		 253 aa  215  7e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324047  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5205  Radical SAM domain protein  44.09 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2519  radical SAM domain-containing protein  41 
 
 		 265 aa  194  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0743  radical SAM family protein  40.23 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000550724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  43.39 
 
 		 251 aa  183  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1234  radical SAM domain-containing protein  41.7 
 
 		 246 aa  176  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0135  hypothetical protein  33.84 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1270  radical SAM family Fe-S protein  35.2 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.53239  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1600  radical SAM domain-containing protein  32.02 
 
 		 242 aa  97.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0871  radical SAM domain-containing protein  32.02 
 
 		 242 aa  95.9  6e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.142358  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0834  radical SAM domain-containing protein  27.45 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0123743  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1076  radical SAM domain-containing protein  31.62 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1090  radical SAM domain-containing protein  31.89 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0037  radical SAM domain-containing protein  25.97 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  28.46 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  27.02 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  28.05 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  29.22 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  26.97 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  30.9 
 
 		 202 aa  67  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  30.89 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  28.44 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  27.41 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  28.78 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  31.54 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  28.4 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  39.6 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  30.1 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  26.83 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3495  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  28.96 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  27.8 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1155  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  36.76 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  26.27 
 
 		 208 aa  57  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  27.81 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0175  radical SAM domain-containing protein  22.41 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  26.73 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  28.29 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0514  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  33.05 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1396  radical SAM domain protein  24.4 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0288655  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0823  FO synthase subunit 2  34.11 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000364278  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  30.92 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  30.92 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  34.92 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  26.17 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1499  radical SAM domain protein  23.81 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000307521  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0156  radical SAM domain-containing protein  21.98 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  25.74 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  28.97 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0327  radical SAM domain-containing protein  33.59 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  28.19 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  28.95 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0580  hypothetical protein  28.79 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.894879  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  28.19 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1460  radical SAM domain-containing protein  23.81 
 
 		 238 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387588  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  24.51 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  33.6 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  29.51 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 		 192 aa  53.1  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3947  radical SAM domain protein  22.36 
 
 		 238 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0197707  normal  0.0210663 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0196  radical SAM domain-containing protein  21.98 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  34.45 
 
 		 216 aa  52.8  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  37.3 
 
 		 251 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  27.15 
 
 		 255 aa  52.4  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  28.34 
 
 		 245 aa  52.4  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  24.42 
 
 		 215 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4937  radical SAM domain-containing protein  27.88 
 
 		 245 aa  52  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0465202  normal  0.450648 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  25.38 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  30.95 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  26.56 
 
 		 212 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1258  radical SAM domain-containing protein  24.02 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.503914  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4051  radical SAM family protein  26.09 
 
 		 246 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  30.65 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2163  radical activating enzyme  34.48 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  25.38 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2619  hypothetical protein  31.62 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.350576  normal  0.864443 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  31.25 
 
 		 213 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  32.5 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  34.51 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  28.69 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  33.88 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  32.32 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18221  putative organic radical activating protein  27.07 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  61.76 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0977  radical SAM domain-containing protein  36.17 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  34.95 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  36.17 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1494  hypothetical protein  29.25 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0718  radical SAM domain-containing protein  33.93 
 
 		 209 aa  50.4  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.525319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>