262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1600 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1600  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
242 aa  496  1e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1076  radical SAM domain-containing protein  95.87 
 
 
242 aa  479  1e-134  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0871  radical SAM domain-containing protein  93.8 
 
 
242 aa  474  1e-133  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.142358  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1090  radical SAM domain-containing protein  80.58 
 
 
242 aa  402  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0834  radical SAM domain-containing protein  57.83 
 
 
248 aa  289  3e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0123743  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1234  radical SAM domain-containing protein  31.87 
 
 
246 aa  128  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  35.34 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1642  organic radical activating enzymes  31.87 
 
 
253 aa  112  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324047  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5205  Radical SAM domain protein  31.5 
 
 
268 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1757  radical SAM domain-containing protein  33.86 
 
 
247 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1846  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
254 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260546  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1785  radical SAM domain-containing protein  33.47 
 
 
249 aa  105  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1721  radical SAM domain-containing protein  31.5 
 
 
250 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0587139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2965  Radical SAM domain protein  31.87 
 
 
251 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1318  Radical SAM domain protein  31.08 
 
 
251 aa  98.6  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.11039  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1658  radical SAM family protein  32.02 
 
 
250 aa  97.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021  normal  0.87771 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2519  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 
265 aa  95.9  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0135  hypothetical protein  31.54 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0743  radical SAM family protein  29.62 
 
 
264 aa  92.4  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000550724  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2122  radical SAM domain-containing protein  29.88 
 
 
250 aa  88.6  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1270  radical SAM family Fe-S protein  31.6 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.53239  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0037  radical SAM domain-containing protein  28.34 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  30.28 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  30.39 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  24.8 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  28.33 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  24.23 
 
 
222 aa  64.7  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  32.87 
 
 
202 aa  63.5  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  29.41 
 
 
234 aa  63.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  27.34 
 
 
222 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 
210 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  29.96 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  29.86 
 
 
204 aa  62.8  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1855  radical activating enzyme  26.62 
 
 
222 aa  62.8  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.328449  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  26.89 
 
 
210 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  28.97 
 
 
220 aa  62.4  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1259  radical SAM domain-containing protein  26.97 
 
 
238 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1232  radical SAM domain-containing protein  26.97 
 
 
238 aa  62.4  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1234  radical SAM domain-containing protein  26.97 
 
 
238 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1361  radical sam domain-containing protein  26.97 
 
 
238 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1432  radical SAM domain protein  26.97 
 
 
238 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000180517 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  29.53 
 
 
214 aa  62  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  29.53 
 
 
214 aa  62  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1499  radical SAM domain protein  26.97 
 
 
238 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000307521  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2163  radical activating enzyme  28.87 
 
 
222 aa  62  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224373  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2116  radical activating enzyme  29.27 
 
 
222 aa  62  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.054229  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
280 aa  61.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  31.85 
 
 
222 aa  61.6  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  25.94 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3515  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic-like  25.82 
 
 
219 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2162  radical activating enzyme  25 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.221208  normal  0.837279 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  28.5 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2348  radical SAM domain-containing protein  34.92 
 
 
222 aa  60.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0536039  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  32.41 
 
 
215 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0580  hypothetical protein  28.06 
 
 
226 aa  60.1  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.894879  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  28.47 
 
 
213 aa  60.1  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1877  radical activating enzyme  23.71 
 
 
222 aa  60.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.460246  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  28.06 
 
 
211 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2268  radical activating enzyme  25.51 
 
 
222 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00320351  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  23.79 
 
 
222 aa  59.7  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  32.58 
 
 
274 aa  59.3  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  28.04 
 
 
215 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2254  radical activating enzyme  32 
 
 
222 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499803  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1692  putative ribonucleotide reductase activating transmembrane protein  23.72 
 
 
223 aa  59.3  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.016777  normal  0.651661 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4540  hypothetical protein  32 
 
 
222 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  25.53 
 
 
223 aa  59.3  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  29.86 
 
 
222 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  27.78 
 
 
212 aa  58.5  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  30.71 
 
 
226 aa  58.5  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  29.86 
 
 
227 aa  58.5  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  27.8 
 
 
217 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  31.94 
 
 
264 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1460  radical SAM domain-containing protein  26.4 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387588  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  31.82 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  30.88 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0977  radical SAM domain-containing protein  22.68 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3444  radical SAM domain-containing protein  22.68 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2014  radical activating enzyme  22.69 
 
 
222 aa  57  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  22.68 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  31.03 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  31.03 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  30.2 
 
 
210 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  32.14 
 
 
223 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  33.82 
 
 
258 aa  56.6  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  27.08 
 
 
227 aa  56.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  34.21 
 
 
210 aa  56.6  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2551  radical activating enzyme  28.47 
 
 
222 aa  56.2  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  0.0345357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  30.34 
 
 
215 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  29.73 
 
 
245 aa  56.2  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6259  Radical SAM domain protein  27.86 
 
 
230 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  30.77 
 
 
197 aa  55.8  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  28.49 
 
 
244 aa  55.8  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  29.66 
 
 
217 aa  55.8  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  28.31 
 
 
244 aa  55.8  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  29.66 
 
 
217 aa  55.8  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0808  radical SAM domain-containing protein  27.34 
 
 
223 aa  55.5  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 
215 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  30.28 
 
 
202 aa  55.5  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  28.28 
 
 
223 aa  55.5  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  31.69 
 
 
216 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>