More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0497 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 212 aa  436  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  56.46 
 
 		 215 aa  232  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  51.18 
 
 		 216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  47.39 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  47.39 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  47.62 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  49.77 
 
 		 234 aa  198  5e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  48.1 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  45.33 
 
 		 245 aa  195  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  51.2 
 
 		 215 aa  194  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  47.37 
 
 		 214 aa  191  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  47.37 
 
 		 214 aa  191  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  46.7 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  45.93 
 
 		 217 aa  190  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  46.41 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  46.7 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  47.64 
 
 		 223 aa  188  7e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  47.17 
 
 		 215 aa  187  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  44.89 
 
 		 244 aa  187  9e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  46.23 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  46.23 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  46.45 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  45.45 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  45.97 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  46.23 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  46.34 
 
 		 210 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  44 
 
 		 244 aa  184  7e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  45.62 
 
 		 226 aa  184  7e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  46.7 
 
 		 215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  43.4 
 
 		 212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  45.71 
 
 		 210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  44.76 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  45.37 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  45.75 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  46.19 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  45.97 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  45.37 
 
 		 210 aa  181  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  45.24 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  45.75 
 
 		 215 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  43.89 
 
 		 226 aa  178  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  42.86 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  42.38 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  47.42 
 
 		 193 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  43.13 
 
 		 223 aa  169  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  42.65 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  41.35 
 
 		 210 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  42.59 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  45.54 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  43.33 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  42.92 
 
 		 211 aa  155  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  43.19 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  39.17 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  42.06 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  39.17 
 
 		 225 aa  148  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  43.14 
 
 		 202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  42.16 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  39.71 
 
 		 234 aa  138  7e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  42.65 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  35.9 
 
 		 253 aa  108  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  36.87 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  33.64 
 
 		 208 aa  94.7  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  30.7 
 
 		 220 aa  92  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  28.51 
 
 		 230 aa  91.3  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  36.12 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3495  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  30.29 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  31.96 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  31.54 
 
 		 242 aa  85.5  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  29.96 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  29.32 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  42.57 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  41.18 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  44.12 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1066  radical SAM domain-containing protein  30.3 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4051  radical SAM family protein  30.86 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  40.78 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  30.88 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  30.3 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  28.57 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  41.9 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  41 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  30.67 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3947  radical SAM domain protein  28.63 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0197707  normal  0.0210663 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  39 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1396  radical SAM domain protein  28.63 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0288655  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  33.61 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1258  radical SAM domain-containing protein  28.63 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.503914  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  30.06 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  30.46 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0659  Radical SAM domain protein  30.06 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.917391  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  29 
 
 		 245 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1460  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 		 238 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387588  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 246 aa  74.7  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1499  radical SAM domain protein  27.31 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000307521  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  30.45 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1432  radical SAM domain protein  27.31 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000180517 
 
 
-
 
NC_004310  BR1974  radical activating enzyme, putative  28.51 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1259  radical SAM domain-containing protein  27.31 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1232  radical SAM domain-containing protein  27.31 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1234  radical SAM domain-containing protein  27.31 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1361  radical sam domain-containing protein  27.31 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>