More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2019 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  452  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  97.7 
 
 
217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  66.05 
 
 
226 aa  300  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  65.12 
 
 
215 aa  299  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  64.65 
 
 
215 aa  296  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  64.65 
 
 
215 aa  294  7e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  64.65 
 
 
215 aa  294  8e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  64.65 
 
 
215 aa  294  8e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  64.65 
 
 
264 aa  294  9e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  64.02 
 
 
215 aa  292  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  64.79 
 
 
216 aa  288  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  63.72 
 
 
215 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  62.79 
 
 
215 aa  287  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  64.81 
 
 
217 aa  285  2.9999999999999996e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  64.81 
 
 
217 aa  285  2.9999999999999996e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  63.51 
 
 
227 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  64.45 
 
 
223 aa  281  4.0000000000000003e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  60.19 
 
 
213 aa  280  2e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  60.19 
 
 
213 aa  280  2e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  63.03 
 
 
233 aa  278  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  61.9 
 
 
212 aa  277  8e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  61.14 
 
 
213 aa  275  3e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  63.33 
 
 
215 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  61.43 
 
 
213 aa  271  6e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  59.72 
 
 
227 aa  270  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  58.77 
 
 
232 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  60.66 
 
 
214 aa  265  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  60.66 
 
 
214 aa  265  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  58.1 
 
 
212 aa  261  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  58.57 
 
 
216 aa  260  1e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  58.85 
 
 
234 aa  258  5.0000000000000005e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  67.54 
 
 
193 aa  258  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  53.57 
 
 
245 aa  245  3e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  54.02 
 
 
244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  53.57 
 
 
244 aa  241  6e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  44.76 
 
 
210 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  47.37 
 
 
215 aa  192  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  44.39 
 
 
210 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  46.41 
 
 
212 aa  189  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  43.41 
 
 
210 aa  187  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  43.6 
 
 
226 aa  187  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  43.41 
 
 
210 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  44.55 
 
 
211 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  41.83 
 
 
210 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  41.78 
 
 
223 aa  174  8e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  41.86 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  42.65 
 
 
220 aa  171  5.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  40.76 
 
 
223 aa  170  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  40.91 
 
 
226 aa  169  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  39.81 
 
 
223 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  41.51 
 
 
223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  37.91 
 
 
209 aa  159  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  42.08 
 
 
202 aa  148  7e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  41.18 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  35.24 
 
 
225 aa  141  8e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  39.71 
 
 
202 aa  134  8e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  39.71 
 
 
202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  37.32 
 
 
234 aa  132  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  31.53 
 
 
253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  32.1 
 
 
258 aa  105  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  35.92 
 
 
220 aa  98.6  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  30.58 
 
 
258 aa  97.1  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  32.72 
 
 
216 aa  94.7  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  32.09 
 
 
216 aa  94  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 
280 aa  91.3  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  33 
 
 
195 aa  91.3  9e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  37.76 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  31.16 
 
 
216 aa  88.6  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  32.87 
 
 
216 aa  88.6  6e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  29.02 
 
 
274 aa  87.8  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  30.29 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  29 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  27.19 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  37.21 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  30.28 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  27.54 
 
 
224 aa  77  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  27.2 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  30.14 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  32.35 
 
 
222 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  28.44 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  28.29 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  32.78 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  28.5 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  28.5 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  39.05 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  27.83 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  33.64 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
222 aa  71.6  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  24.88 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  31.61 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  30.71 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  27.54 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  35.25 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1899  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  30.22 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  28.64 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0978  hypothetical protein  27.12 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3444  radical SAM domain-containing protein  35.25 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  27.35 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  28.65 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>