More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1757 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1757  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 247 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2122  radical SAM domain-containing protein  47.15 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2965  Radical SAM domain protein  46.99 
 
 		 251 aa  218  6e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267207 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1721  radical SAM domain-containing protein  45.34 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0587139  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1658  radical SAM family protein  44.72 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021  normal  0.87771 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1318  Radical SAM domain protein  46.18 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.11039  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5205  Radical SAM domain protein  46.06 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  43.33 
 
 		 251 aa  197  9e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1234  radical SAM domain-containing protein  40.57 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1846  Radical SAM domain protein  42.08 
 
 		 254 aa  191  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260546  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1642  organic radical activating enzymes  41.87 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324047  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0743  radical SAM family protein  40.78 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000550724  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2519  radical SAM domain-containing protein  39.84 
 
 		 265 aa  183  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1785  radical SAM domain-containing protein  40.82 
 
 		 249 aa  162  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1270  radical SAM family Fe-S protein  37.35 
 
 		 238 aa  142  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.53239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0135  hypothetical protein  37.88 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0834  radical SAM domain-containing protein  31.75 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0123743  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1600  radical SAM domain-containing protein  33.86 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1090  radical SAM domain-containing protein  34.13 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1076  radical SAM domain-containing protein  33.07 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0871  radical SAM domain-containing protein  32.27 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.142358  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  31.91 
 
 		 209 aa  85.5  8e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  32.2 
 
 		 234 aa  85.1  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0037  radical SAM domain-containing protein  26.1 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  29.29 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  28.44 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  27.96 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0922  hypothetical protein  35.66 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  31.15 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  27.82 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  26.5 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  29.03 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  33.56 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  32.56 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2645  hypothetical protein  35.61 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  30.29 
 
 		 202 aa  65.1  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  26.56 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3243  hypothetical protein  34.88 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.474711  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1354  hypothetical protein  34.35 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.129459 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  26.5 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2960  radical SAM family protein  27.97 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  30.09 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  26.94 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  34.43 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0978  hypothetical protein  26.14 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  34.27 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  33.85 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1382  hypothetical protein  34.04 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41745  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4051  radical SAM family protein  24.9 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1403  organic radical activating-like protein  32.14 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.962415  normal  0.246336 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1300  hypothetical protein  33.59 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0808  radical SAM domain-containing protein  26.83 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  31.49 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  34.43 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3844  hypothetical protein  34.35 
 
 		 212 aa  62  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 243 aa  62  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  35.59 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  31.75 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  29.79 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  33.87 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  26.63 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4095  hypothetical protein  34.35 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0823  FO synthase subunit 2  31.17 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000364278  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3395  hypothetical protein  33.33 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.709482  normal  0.257118 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0526  hypothetical protein  33.33 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313091  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  26.86 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2619  hypothetical protein  33.85 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.350576  normal  0.864443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1198  hypothetical protein  32.39 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.949639 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0659  Radical SAM domain protein  26.27 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.917391  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  34.09 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  32.97 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1494  hypothetical protein  32.82 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  29.23 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1045  hypothetical protein  35.11 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0321486  normal  0.408994 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3115  organic radical activating enzyme-like protein  33.56 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.369286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3149  hypothetical protein  33.59 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105264  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1877  radical activating enzyme  26.67 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.460246  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  32.5 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2382  hypothetical protein  33.85 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133119  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  32.5 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  26.64 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  35.54 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1855  radical activating enzyme  24.9 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.328449  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0196  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1221  hypothetical protein  31.3 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.688566 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0580  hypothetical protein  30.4 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.894879  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0871  putative coenzyme PQQ synthesis protein  24.71 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.398462  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  34.68 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  30.83 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2116  radical activating enzyme  24.9 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.054229  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1382  hypothetical protein  31.3 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.980113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  23.89 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  25.2 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  28.43 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2757  organic radical activating-like protein  32.82 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>