More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1985 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 215 aa  437  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  56.46 
 
 		 212 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  49.1 
 
 		 226 aa  214  9e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  50 
 
 		 227 aa  206  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  52.17 
 
 		 216 aa  202  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  49.55 
 
 		 220 aa  202  3e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  49.04 
 
 		 212 aa  202  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  49.09 
 
 		 223 aa  201  6e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  50.72 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  49.54 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  47.49 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  48.06 
 
 		 213 aa  197  7.999999999999999e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  47.85 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  49.51 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  49.51 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  47.91 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  49.76 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  47.37 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  49.52 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  48.79 
 
 		 213 aa  195  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  50.23 
 
 		 211 aa  194  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  47.6 
 
 		 227 aa  194  7e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  49.28 
 
 		 215 aa  194  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  50.23 
 
 		 223 aa  193  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  48.57 
 
 		 215 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  47.89 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  47.37 
 
 		 217 aa  192  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  48.8 
 
 		 215 aa  191  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  47.34 
 
 		 212 aa  191  8e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  50.93 
 
 		 223 aa  191  9e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  47.83 
 
 		 233 aa  191  9e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  47.62 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  47.62 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  47.14 
 
 		 215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  47.85 
 
 		 215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  46.86 
 
 		 232 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  46.36 
 
 		 223 aa  187  8e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  47.62 
 
 		 215 aa  187  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  48.65 
 
 		 222 aa  187  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  45.37 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  45.54 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  46.7 
 
 		 213 aa  185  4e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  46.7 
 
 		 213 aa  185  4e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  45.89 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  44.3 
 
 		 244 aa  182  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  45.89 
 
 		 217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  49.06 
 
 		 215 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  44.13 
 
 		 210 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  44.13 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  43.86 
 
 		 244 aa  179  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  50.26 
 
 		 193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  39.91 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  44.65 
 
 		 209 aa  161  7e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  42.24 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  41.26 
 
 		 202 aa  141  6e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  41.26 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  37.14 
 
 		 234 aa  135  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  41.06 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  40.69 
 
 		 202 aa  132  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  42.54 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  43.93 
 
 		 258 aa  95.5  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  33.18 
 
 		 195 aa  94  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  40.78 
 
 		 220 aa  91.7  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  34.42 
 
 		 210 aa  91.7  9e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  43.27 
 
 		 274 aa  88.2  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  31.08 
 
 		 227 aa  88.2  9e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  35.78 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  31.44 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2551  radical activating enzyme  28.38 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  0.0345357 
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  32.87 
 
 		 197 aa  85.5  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  29 
 
 		 222 aa  85.1  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  34.86 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  32.78 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  42.99 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1877  radical activating enzyme  30 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.460246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  29.91 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2014  radical activating enzyme  28.7 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  42.16 
 
 		 280 aa  81.6  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  29.13 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  31.33 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  28.32 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2116  radical activating enzyme  28.88 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.054229  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  43.69 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1855  radical activating enzyme  28.88 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.328449  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4540  hypothetical protein  28.38 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  43.69 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2254  radical activating enzyme  28.38 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499803  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2162  radical activating enzyme  30.17 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.221208  normal  0.837279 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2348  radical SAM domain-containing protein  29.74 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0536039  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  32.49 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  35.47 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  30.1 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  30.1 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  41.58 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2268  radical activating enzyme  28.38 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00320351  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4051  radical SAM family protein  35.29 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  29.55 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  31.39 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  29.26 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1825  radical activating enzyme  28.44 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.40401  normal  0.903036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>