More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0593 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 251 aa  510  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1234  radical SAM domain-containing protein  49.59 
 
 		 246 aa  209  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1757  radical SAM domain-containing protein  43.33 
 
 		 247 aa  197  9e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2965  Radical SAM domain protein  44.94 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1318  Radical SAM domain protein  42.51 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.11039  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1721  radical SAM domain-containing protein  41.87 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0587139  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2122  radical SAM domain-containing protein  40.65 
 
 		 250 aa  185  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1658  radical SAM family protein  43.39 
 
 		 250 aa  183  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021  normal  0.87771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5205  Radical SAM domain protein  41.43 
 
 		 268 aa  178  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1846  Radical SAM domain protein  39.83 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260546  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1642  organic radical activating enzymes  39.59 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324047  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0743  radical SAM family protein  35.85 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000550724  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2519  radical SAM domain-containing protein  35.88 
 
 		 265 aa  153  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1785  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1270  radical SAM family Fe-S protein  38.31 
 
 		 238 aa  152  7e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.53239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0135  hypothetical protein  35.5 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1076  radical SAM domain-containing protein  35.34 
 
 		 242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1600  radical SAM domain-containing protein  35.34 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0871  radical SAM domain-containing protein  34.14 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.142358  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0834  radical SAM domain-containing protein  31.89 
 
 		 248 aa  121  8e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0123743  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1090  radical SAM domain-containing protein  33.07 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  30.8 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  32.78 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1396  radical SAM domain protein  28.51 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0288655  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  25.1 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  25.91 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  29.57 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3947  radical SAM domain protein  28.16 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0197707  normal  0.0210663 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  28.33 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1258  radical SAM domain-containing protein  28.1 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.503914  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  28.23 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  29.92 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  28.23 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1499  radical SAM domain protein  27.94 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000307521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1259  radical SAM domain-containing protein  27.35 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1234  radical SAM domain-containing protein  27.35 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1361  radical sam domain-containing protein  27.35 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1432  radical SAM domain protein  27.35 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000180517 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1460  radical SAM domain-containing protein  27.76 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  29.49 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  33.86 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  27.85 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4051  radical SAM family protein  29.96 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0037  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1066  radical SAM domain-containing protein  26.94 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1232  radical SAM domain-containing protein  26.94 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  29.92 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  29.39 
 
 		 242 aa  72  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  37.1 
 
 		 206 aa  72  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2162  radical activating enzyme  25.4 
 
 		 222 aa  72  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.221208  normal  0.837279 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  27.66 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  31.71 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1855  radical activating enzyme  24.51 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.328449  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2116  radical activating enzyme  25.3 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.054229  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  25.59 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  35.29 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  30.67 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  34.64 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  25.69 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0978  hypothetical protein  27.17 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  30.67 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  33.57 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  26.94 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  30.04 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2014  radical activating enzyme  27.45 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  28.44 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1877  radical activating enzyme  33.58 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.460246  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2163  radical activating enzyme  25.3 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  31.4 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0907  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  41.35 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  24.9 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  31.54 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0580  hypothetical protein  32.03 
 
 		 226 aa  67  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.894879  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  38.46 
 
 		 202 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  34.01 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  39.02 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  31.29 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  33.8 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  32.46 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  26.48 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  30.17 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003398  queuosine Biosynthesis QueE Radical SAM  31.13 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.593414  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0823  FO synthase subunit 2  36.43 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000364278  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  30.28 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  34.72 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2254  radical activating enzyme  24.21 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499803  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4540  hypothetical protein  24.21 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  26.89 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  28.44 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2960  radical SAM family protein  31.85 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  30.42 
 
 		 214 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  30.42 
 
 		 214 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  39.39 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0225  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  35.97 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0603054  normal  0.555602 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  28.27 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2268  radical activating enzyme  24.21 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00320351  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  29.71 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  31.95 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>