More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1846 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1846  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 254 aa  518  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260546  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1658  radical SAM family protein  48.56 
 
 		 250 aa  253  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021  normal  0.87771 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1642  organic radical activating enzymes  48.61 
 
 		 253 aa  251  6e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324047  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2122  radical SAM domain-containing protein  45.31 
 
 		 250 aa  249  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1785  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 		 249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2965  Radical SAM domain protein  47.33 
 
 		 251 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267207 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1721  radical SAM domain-containing protein  44.44 
 
 		 250 aa  231  9e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0587139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1318  Radical SAM domain protein  46.09 
 
 		 251 aa  228  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.11039  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1234  radical SAM domain-containing protein  43.78 
 
 		 246 aa  195  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1757  radical SAM domain-containing protein  42.08 
 
 		 247 aa  191  9e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2519  radical SAM domain-containing protein  41.98 
 
 		 265 aa  189  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5205  Radical SAM domain protein  41.41 
 
 		 268 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0743  radical SAM family protein  40.75 
 
 		 264 aa  182  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000550724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  39.83 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0135  hypothetical protein  36.68 
 
 		 258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0834  radical SAM domain-containing protein  33.86 
 
 		 248 aa  130  3e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0123743  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1270  radical SAM family Fe-S protein  33.6 
 
 		 238 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.53239  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1600  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0871  radical SAM domain-containing protein  31.85 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.142358  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1090  radical SAM domain-containing protein  33.87 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1076  radical SAM domain-containing protein  32.53 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  32.05 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  27.35 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  32.92 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  30.89 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  30.58 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  29.96 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  28.57 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1066  radical SAM domain-containing protein  26.98 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  33.49 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0037  radical SAM domain-containing protein  24.22 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  27.67 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  31.6 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  27.16 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  25.7 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  27.72 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1232  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1396  radical SAM domain protein  25.68 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0288655  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3947  radical SAM domain protein  24.51 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0197707  normal  0.0210663 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  34.27 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  33.97 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1499  radical SAM domain protein  25.68 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000307521  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  34.75 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1259  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 238 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1234  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 238 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  35.48 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1361  radical sam domain-containing protein  25.29 
 
 		 238 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0823  FO synthase subunit 2  25.36 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000364278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1432  radical SAM domain protein  25.29 
 
 		 238 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000180517 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  32.24 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  34.96 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3134  organic radical activating enzyme-like protein  29.3 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.260686 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2504  organic radical activating enzymes-like  29.3 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3118  organic radical activating enzymes-like protein  29.3 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  34.19 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3115  organic radical activating enzyme-like protein  29.3 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.369286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0935  hypothetical protein  29.78 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000274693  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02622  hypothetical protein  29.41 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0912  conserved hypothetical protein  29.41 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1460  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  27.24 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02584  hypothetical protein  29.41 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6469  organic radical activating-like protein  28.52 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0138  hypothetical protein  28.91 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620978  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2910  hypothetical protein  29.41 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000863859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3056  organic radical activating enzyme-like protein  29.3 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  29.41 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1258  radical SAM domain-containing protein  26.17 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.503914  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3173  organic radical activating enzyme-like protein  29.3 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.655462  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  29.41 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.7449199999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  29.41 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0808  radical SAM domain-containing protein  28.74 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3099  hypothetical protein  29.41 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000109551  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  34.19 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2364  hypothetical protein  28.52 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0162  organic radical activating protein  28.52 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495618  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0153  hypothetical protein  28.52 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0357  GntS  28.52 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  34.69 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  37.1 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  36.36 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1354  hypothetical protein  34.93 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.129459 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2285  hypothetical protein  28.52 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2794  hypothetical protein  28.52 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3229  radical SAM domain-containing protein  27.19 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000624181  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  26.53 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  28.15 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0172  hypothetical protein  28.52 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  34.01 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3243  hypothetical protein  31.22 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.474711  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  33.97 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2619  hypothetical protein  35.56 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.350576  normal  0.864443 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  26.14 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3084  radical SAM domain protein  28.41 
 
 		 223 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000255818  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3148  radical SAM domain-containing protein  28.41 
 
 		 223 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000734892  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3265  radical SAM domain-containing protein  28.41 
 
 		 223 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3167  hypothetical protein  28.41 
 
 		 223 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000157264  normal  0.548962 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3109  radical SAM domain protein  28.68 
 
 		 223 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000108893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>