More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1974 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 210 aa  433  1e-121  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  68.57 
 
 		 208 aa  308  4e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  42.31 
 
 		 216 aa  144  9e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  39.05 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  38.21 
 
 		 216 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  42.86 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  38.77 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  38.46 
 
 		 216 aa  125  6e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  37.13 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  34.33 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  36.87 
 
 		 247 aa  108  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  36.54 
 
 		 234 aa  104  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  35.89 
 
 		 246 aa  104  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  30.99 
 
 		 220 aa  104  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  32.33 
 
 		 258 aa  102  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  35.94 
 
 		 202 aa  101  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  32.43 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  36.87 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  32.07 
 
 		 274 aa  96.7  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  36.57 
 
 		 202 aa  96.7  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  29.22 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  32.29 
 
 		 223 aa  94.7  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  34.58 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  33.81 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  34.12 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  34.58 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  33.96 
 
 		 227 aa  94  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  30.56 
 
 		 280 aa  94.4  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  34.12 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  33.78 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  35.14 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  48 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  30.04 
 
 		 258 aa  93.2  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  33.71 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  33.49 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  32.23 
 
 		 260 aa  92.4  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  32.41 
 
 		 213 aa  91.7  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  31.72 
 
 		 251 aa  91.7  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02622  hypothetical protein  36.05 
 
 		 223 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0912  conserved hypothetical protein  36.05 
 
 		 223 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203902  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  36.05 
 
 		 223 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.7449199999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  36.05 
 
 		 223 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02584  hypothetical protein  36.05 
 
 		 223 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2910  hypothetical protein  36.05 
 
 		 223 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000863859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  36.05 
 
 		 223 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3099  hypothetical protein  36.05 
 
 		 223 aa  91.3  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000109551  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  31.53 
 
 		 223 aa  91.7  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  34.42 
 
 		 215 aa  91.7  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  30.13 
 
 		 222 aa  91.3  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0935  hypothetical protein  36.05 
 
 		 223 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000274693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  33.49 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  33.18 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0808  radical SAM domain-containing protein  34.25 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0977  radical SAM domain-containing protein  35.37 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  31.58 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3265  radical SAM domain-containing protein  34.69 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3167  hypothetical protein  34.69 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000157264  normal  0.548962 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3084  radical SAM domain protein  34.69 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000255818  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  35.37 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3109  radical SAM domain protein  34.69 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000108893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3444  radical SAM domain-containing protein  35.37 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3148  radical SAM domain-containing protein  34.69 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000734892  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  44.55 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  33.18 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  30.62 
 
 		 217 aa  89  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  30.08 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  37.5 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  37.76 
 
 		 222 aa  88.6  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  42.64 
 
 		 197 aa  88.6  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  30.89 
 
 		 226 aa  88.2  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  31.63 
 
 		 215 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  30.59 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  33.65 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  32.07 
 
 		 246 aa  86.7  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  30.59 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  30.2 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  38.17 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  39.55 
 
 		 225 aa  85.9  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3229  radical SAM domain-containing protein  33.56 
 
 		 223 aa  85.9  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000624181  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  29.33 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  30.66 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  30.59 
 
 		 226 aa  85.5  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  33.64 
 
 		 210 aa  85.9  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  29.33 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  38.17 
 
 		 205 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  30.2 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  34.93 
 
 		 222 aa  85.1  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  35.54 
 
 		 205 aa  84.7  8e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  31.1 
 
 		 226 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  32.09 
 
 		 234 aa  85.1  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  30.7 
 
 		 213 aa  84.7  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  30.52 
 
 		 227 aa  84.7  9e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  39.86 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  43.56 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  29.81 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  34.93 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  32.24 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  30.19 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  30.7 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  39.07 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>