More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1642 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1642  organic radical activating enzymes  100 
 
 		 253 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324047  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1846  Radical SAM domain protein  48.61 
 
 		 254 aa  251  6e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260546  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2965  Radical SAM domain protein  51.63 
 
 		 251 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1318  Radical SAM domain protein  50.41 
 
 		 251 aa  234  9e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.11039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2122  radical SAM domain-containing protein  46.37 
 
 		 250 aa  230  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1658  radical SAM family protein  44.08 
 
 		 250 aa  215  7e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021  normal  0.87771 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1721  radical SAM domain-containing protein  44.9 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0587139  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1785  radical SAM domain-containing protein  48.96 
 
 		 249 aa  209  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1757  radical SAM domain-containing protein  41.87 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0743  radical SAM family protein  40.15 
 
 		 264 aa  176  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000550724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1234  radical SAM domain-containing protein  41.77 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5205  Radical SAM domain protein  40.15 
 
 		 268 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2519  radical SAM domain-containing protein  39.15 
 
 		 265 aa  158  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  39.59 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0135  hypothetical protein  34.81 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1270  radical SAM family Fe-S protein  34.78 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.53239  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0834  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0123743  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1090  radical SAM domain-containing protein  31.6 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1600  radical SAM domain-containing protein  31.87 
 
 		 242 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0871  radical SAM domain-containing protein  31.47 
 
 		 242 aa  111  9e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.142358  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1076  radical SAM domain-containing protein  31.08 
 
 		 242 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0037  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  39.1 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  29.1 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  29.18 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  27.53 
 
 		 208 aa  71.6  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  29.48 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  26.58 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0659  Radical SAM domain protein  28.74 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.815067  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  27.2 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  29.06 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  37.93 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  41.1 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  27.16 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0734  radical SAM domain-containing protein  26 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  25.21 
 
 		 192 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0750  radical SAM domain-containing protein  26 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2960  radical SAM family protein  29.51 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3395  hypothetical protein  34.62 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.709482  normal  0.257118 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0327  radical SAM domain-containing protein  30.24 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1460  radical SAM domain-containing protein  28.11 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387588  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  39.5 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1066  radical SAM domain-containing protein  26.1 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  33.77 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  35.95 
 
 		 202 aa  65.1  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  28.1 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3243  hypothetical protein  38.69 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.474711  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  34.72 
 
 		 211 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2177  radical SAM domain-containing protein  37.25 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.401056 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  32.06 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1848  hypothetical protein  32.9 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361359  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  28.02 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  28.69 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2645  hypothetical protein  36.24 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  36.05 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1259  radical SAM domain-containing protein  27.31 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1234  radical SAM domain-containing protein  27.31 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1361  radical sam domain-containing protein  27.31 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  32.06 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1432  radical SAM domain protein  27.31 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000180517 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1418  radical SAM domain-containing protein  36.64 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6469  organic radical activating-like protein  34.23 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  33.99 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3115  organic radical activating enzyme-like protein  34.9 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.369286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  33.77 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  30.58 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4095  hypothetical protein  36.43 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1382  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.980113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1221  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.688566 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3380  hypothetical protein  32.58 
 
 		 212 aa  62  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  30 
 
 		 227 aa  62  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3056  organic radical activating enzyme-like protein  34.23 
 
 		 210 aa  62  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3173  organic radical activating enzyme-like protein  34.23 
 
 		 210 aa  62  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.655462  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1899  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  26.73 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0175  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3947  radical SAM domain protein  27.89 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0197707  normal  0.0210663 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1499  radical SAM domain protein  26.91 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000307521  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  30.67 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3844  hypothetical protein  31.98 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  37.4 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  32.06 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  26.09 
 
 		 245 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  30.67 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  36.67 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_004310  BR1974  radical activating enzyme, putative  26.73 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1232  radical SAM domain-containing protein  26.91 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1396  radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0288655  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3134  organic radical activating enzyme-like protein  33.56 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.260686 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0138  hypothetical protein  34 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620978  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  37.23 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2504  organic radical activating enzymes-like  33.56 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160261  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1329  hypothetical protein  33.77 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  31.4 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3118  organic radical activating enzymes-like protein  33.56 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1082  hypothetical protein  39.39 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0796738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  36.64 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>