More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2226 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  100 
 
 		 227 aa  467  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  72.51 
 
 		 213 aa  327  1.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  73.58 
 
 		 213 aa  324  5e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  63.95 
 
 		 233 aa  314  7e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  68.25 
 
 		 217 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  68.25 
 
 		 217 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  68.81 
 
 		 226 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  66.22 
 
 		 223 aa  300  8.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  66.51 
 
 		 213 aa  296  2e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  66.51 
 
 		 213 aa  296  2e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  67.92 
 
 		 215 aa  295  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  65.61 
 
 		 264 aa  295  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  67.14 
 
 		 216 aa  289  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  63.98 
 
 		 217 aa  286  1e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  61.93 
 
 		 234 aa  286  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  66.19 
 
 		 216 aa  285  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  65.73 
 
 		 215 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  65.73 
 
 		 215 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  63.51 
 
 		 212 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  63.51 
 
 		 217 aa  282  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  64.79 
 
 		 215 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  64.79 
 
 		 215 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  64.32 
 
 		 215 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  65.26 
 
 		 215 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  64.32 
 
 		 215 aa  280  9e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  64.76 
 
 		 214 aa  280  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  64.76 
 
 		 214 aa  280  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  62.38 
 
 		 212 aa  275  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  61.97 
 
 		 232 aa  274  7e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  66.99 
 
 		 215 aa  272  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  63.33 
 
 		 227 aa  270  9e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  66.15 
 
 		 193 aa  259  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  53.22 
 
 		 244 aa  249  3e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  53.65 
 
 		 245 aa  248  6e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  52.36 
 
 		 244 aa  246  2e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  48.79 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  48.31 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  47.83 
 
 		 210 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  47.62 
 
 		 212 aa  199  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  46.34 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  46.88 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  43.13 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  45.75 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  45.02 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  46.12 
 
 		 211 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  44.13 
 
 		 223 aa  178  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  45.5 
 
 		 223 aa  177  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  41.23 
 
 		 209 aa  175  6e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  44.34 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  43.72 
 
 		 223 aa  168  7e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  41.86 
 
 		 223 aa  165  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  45.54 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  36.49 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  42.16 
 
 		 202 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  41.67 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  40.28 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  40.69 
 
 		 202 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  38.29 
 
 		 253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 216 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  34.33 
 
 		 230 aa  108  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  36.99 
 
 		 216 aa  101  9e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  31.71 
 
 		 258 aa  101  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  34.74 
 
 		 260 aa  99  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  38.12 
 
 		 216 aa  98.2  8e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  41.18 
 
 		 280 aa  96.7  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  41.88 
 
 		 274 aa  96.3  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  35.78 
 
 		 216 aa  95.9  5e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  39.62 
 
 		 220 aa  94.4  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  33.96 
 
 		 210 aa  94  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  29.19 
 
 		 208 aa  88.6  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  31.6 
 
 		 231 aa  88.2  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  32.26 
 
 		 255 aa  85.5  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  40.52 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  32.62 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  30.99 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  31.02 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1974  radical activating enzyme, putative  29.73 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4051  radical SAM family protein  30.38 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  34.38 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1899  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  29.41 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1066  radical SAM domain-containing protein  24.8 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  32.06 
 
 		 222 aa  72  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  27.73 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1877  radical activating enzyme  33.61 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.460246  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  34.33 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3495  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  30.42 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  29.96 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2254  radical activating enzyme  31.82 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499803  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  25.79 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2268  radical activating enzyme  31.82 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00320351  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  27.62 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4540  hypothetical protein  31.82 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  27.4 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  33.09 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4937  radical SAM domain-containing protein  31.97 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0465202  normal  0.450648 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  38.84 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  35.48 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>