More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0896 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  100 
 
 		 245 aa  508  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1772  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  73.36 
 
 		 244 aa  378  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1232  radical SAM domain-containing protein  67.5 
 
 		 238 aa  356  1.9999999999999998e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1432  radical SAM domain protein  67.5 
 
 		 238 aa  355  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000180517 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1259  radical SAM domain-containing protein  67.5 
 
 		 238 aa  355  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1234  radical SAM domain-containing protein  67.5 
 
 		 238 aa  355  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1361  radical sam domain-containing protein  67.5 
 
 		 238 aa  355  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.297058  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1499  radical SAM domain protein  67.08 
 
 		 238 aa  354  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000307521  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1258  radical SAM domain-containing protein  67.08 
 
 		 238 aa  353  1e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.503914  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1066  radical SAM domain-containing protein  67.5 
 
 		 238 aa  353  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3947  radical SAM domain protein  67.08 
 
 		 238 aa  351  5e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0197707  normal  0.0210663 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1460  radical SAM domain-containing protein  66.67 
 
 		 238 aa  350  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1396  radical SAM domain protein  66.25 
 
 		 238 aa  346  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0288655  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0750  radical SAM domain-containing protein  63.75 
 
 		 237 aa  318  7e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0734  radical SAM domain-containing protein  63.75 
 
 		 237 aa  318  7e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0371  exsD protein  60.37 
 
 		 212 aa  278  5e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0871  putative coenzyme PQQ synthesis protein  53.72 
 
 		 238 aa  240  1e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.398462  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  47.37 
 
 		 242 aa  224  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4051  radical SAM family protein  47.11 
 
 		 246 aa  216  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  46.91 
 
 		 246 aa  215  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3495  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  46.94 
 
 		 242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3716  radical activating protein  47.13 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.235387  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1974  radical activating enzyme, putative  44.76 
 
 		 251 aa  209  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  46.86 
 
 		 235 aa  208  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1899  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  44.35 
 
 		 247 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  45.57 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4937  radical SAM domain-containing protein  43.72 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0465202  normal  0.450648 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  36.02 
 
 		 209 aa  118  7.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  29.6 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  29.32 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  30.08 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  29.8 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  31.95 
 
 		 210 aa  89  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  31.54 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  32.8 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  30.58 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  31.54 
 
 		 210 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  39.86 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  30.92 
 
 		 216 aa  85.1  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  30.36 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  32.39 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  28.06 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  29.32 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  29.63 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  32.72 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  29.26 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  27.16 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  32 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  38.3 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  29.05 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  27 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  33.15 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  30.33 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  25.82 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  29.74 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  29.55 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  25.82 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  32.04 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  33.16 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18811  putative organic radical activating protein  29.57 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.533025  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  25.57 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  26.51 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  26.94 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  36.67 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  34.48 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  28.92 
 
 		 202 aa  72  0.000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  25.48 
 
 		 223 aa  72  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  30.51 
 
 		 205 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  36.15 
 
 		 280 aa  72  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0743  radical SAM family protein  27.06 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000550724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  30.51 
 
 		 205 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5205  Radical SAM domain protein  27.14 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  35.34 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  27.16 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  28.46 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  33.83 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  26.53 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  26.94 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  29.1 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19001  putative organic radical activating protein  32.64 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.843472  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  26.21 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  29.61 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  28.81 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  26.12 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  29.35 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  29.03 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1877  radical activating enzyme  33.33 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.460246  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3444  radical SAM domain-containing protein  34.27 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0977  radical SAM domain-containing protein  34.27 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  31.62 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  26.59 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  34.27 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  30.63 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  30.41 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  30.18 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  25.3 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18811  putative organic radical activating protein  31.69 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.409827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>