285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6932 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  437  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  65.31 
 
 		 207 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  61.88 
 
 		 205 aa  278  5e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  64.77 
 
 		 193 aa  278  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  59.62 
 
 		 216 aa  275  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0659  Radical SAM domain protein  58.85 
 
 		 210 aa  257  7e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.917391  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  55.34 
 
 		 210 aa  246  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06800  hypothetical protein  58.16 
 
 		 210 aa  246  3e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0516243  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  48.24 
 
 		 210 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  48.8 
 
 		 206 aa  202  4e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  46.83 
 
 		 205 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  46.83 
 
 		 205 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18811  putative organic radical activating protein  43.84 
 
 		 223 aa  183  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.533025  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  45.32 
 
 		 205 aa  177  8e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  39.73 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  40.81 
 
 		 226 aa  171  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  43.07 
 
 		 205 aa  170  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18221  putative organic radical activating protein  42.15 
 
 		 226 aa  167  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21641  putative organic radical activating protein  45.93 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1292  putative organic radical activating protein  45.93 
 
 		 213 aa  165  5e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19001  putative organic radical activating protein  38.91 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.843472  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18811  putative organic radical activating protein  38.81 
 
 		 223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.409827  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  37.06 
 
 		 195 aa  139  3.9999999999999997e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2285  hypothetical protein  39.44 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0153  hypothetical protein  39.44 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0357  GntS  39.44 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2364  hypothetical protein  39.44 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0162  organic radical activating protein  39.44 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2794  hypothetical protein  39.44 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0172  hypothetical protein  39.44 
 
 		 210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0138  hypothetical protein  39.44 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3056  organic radical activating enzyme-like protein  38.14 
 
 		 210 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3173  organic radical activating enzyme-like protein  38.14 
 
 		 210 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.655462  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  38.71 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  38.14 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3148  radical SAM domain-containing protein  36.4 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000734892  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3167  hypothetical protein  36.4 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000157264  normal  0.548962 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3084  radical SAM domain protein  36.4 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000255818  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3109  radical SAM domain protein  36.4 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000108893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3265  radical SAM domain-containing protein  36.4 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0580  hypothetical protein  36.94 
 
 		 226 aa  115  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.894879  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  38.07 
 
 		 211 aa  114  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6469  organic radical activating-like protein  37.5 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3134  organic radical activating enzyme-like protein  38.03 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.260686 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  35.68 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2504  organic radical activating enzymes-like  38.03 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3118  organic radical activating enzymes-like protein  38.03 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0044  radical SAM domain-containing protein  37.96 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  34.53 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3115  organic radical activating enzyme-like protein  38.5 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.369286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2163  radical activating enzyme  33.93 
 
 		 222 aa  111  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0935  hypothetical protein  36.4 
 
 		 223 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000274693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3099  hypothetical protein  35.96 
 
 		 223 aa  111  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000109551  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02622  hypothetical protein  35.96 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0912  conserved hypothetical protein  35.96 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203902  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  35.43 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3229  radical SAM domain-containing protein  35.27 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000624181  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2910  hypothetical protein  35.96 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000863859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  35.96 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.7449199999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  35.96 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  35.96 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02584  hypothetical protein  35.96 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  35.4 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2116  radical activating enzyme  34.38 
 
 		 222 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.054229  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  33.63 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2162  radical activating enzyme  34.38 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.221208  normal  0.837279 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  35.27 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4540  hypothetical protein  34.38 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2254  radical activating enzyme  34.38 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499803  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2268  radical activating enzyme  34.38 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00320351  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  36.16 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  33.03 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0978  hypothetical protein  32.73 
 
 		 245 aa  106  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2348  radical SAM domain-containing protein  35.11 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0536039  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0977  radical SAM domain-containing protein  33.03 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3444  radical SAM domain-containing protein  33.03 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0808  radical SAM domain-containing protein  33.91 
 
 		 223 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  33.93 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1877  radical activating enzyme  33.48 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.460246  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1855  radical activating enzyme  33.63 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.328449  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2551  radical activating enzyme  33.78 
 
 		 222 aa  105  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  0.0345357 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2014  radical activating enzyme  32.89 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2645  hypothetical protein  34.72 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1082  hypothetical protein  36.15 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0796738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003398  queuosine Biosynthesis QueE Radical SAM  32.57 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.593414  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1825  radical activating enzyme  30.93 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.40401  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  34.19 
 
 		 246 aa  102  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  31.86 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1382  hypothetical protein  34.56 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.980113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1221  hypothetical protein  34.56 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.688566 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0220  hypothetical protein  33.04 
 
 		 223 aa  101  9e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  35.56 
 
 		 224 aa  101  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  31.7 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2382  hypothetical protein  36.15 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133119  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  34.88 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02385  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  33.49 
 
 		 207 aa  99  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0526  hypothetical protein  34.84 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313091  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3243  hypothetical protein  34.26 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.474711  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2619  hypothetical protein  34.4 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.350576  normal  0.864443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>