288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2268 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2268  radical activating enzyme  100 
 
 		 222 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00320351  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2254  radical activating enzyme  99.1 
 
 		 222 aa  460  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499803  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4540  hypothetical protein  99.1 
 
 		 222 aa  460  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2162  radical activating enzyme  98.2 
 
 		 222 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.221208  normal  0.837279 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2116  radical activating enzyme  96.85 
 
 		 222 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.054229  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1855  radical activating enzyme  92.79 
 
 		 222 aa  432  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.328449  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  87.84 
 
 		 222 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  86.94 
 
 		 222 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2163  radical activating enzyme  87.39 
 
 		 222 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  86.94 
 
 		 222 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2014  radical activating enzyme  80.18 
 
 		 222 aa  379  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1877  radical activating enzyme  79.73 
 
 		 222 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.460246  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2348  radical SAM domain-containing protein  75.23 
 
 		 222 aa  364  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0536039  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1825  radical activating enzyme  75.91 
 
 		 233 aa  359  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.40401  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  75.23 
 
 		 222 aa  358  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2551  radical activating enzyme  71.17 
 
 		 222 aa  347  9e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  0.0345357 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  72.97 
 
 		 222 aa  347  1e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0978  hypothetical protein  62.27 
 
 		 245 aa  291  6e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3084  radical SAM domain protein  59.46 
 
 		 223 aa  284  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000255818  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3167  hypothetical protein  59.46 
 
 		 223 aa  284  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000157264  normal  0.548962 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3265  radical SAM domain-containing protein  59.46 
 
 		 223 aa  284  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3148  radical SAM domain-containing protein  59.46 
 
 		 223 aa  284  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000734892  normal  0.311004 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02622  hypothetical protein  59.01 
 
 		 223 aa  282  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0912  conserved hypothetical protein  59.01 
 
 		 223 aa  282  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203902  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2910  hypothetical protein  59.01 
 
 		 223 aa  282  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000863859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  59.01 
 
 		 223 aa  282  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.7449199999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02584  hypothetical protein  59.01 
 
 		 223 aa  282  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  59.01 
 
 		 223 aa  282  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  59.01 
 
 		 223 aa  282  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0935  hypothetical protein  59.01 
 
 		 223 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000274693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3099  hypothetical protein  59.01 
 
 		 223 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000109551  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3109  radical SAM domain protein  59.01 
 
 		 223 aa  281  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000108893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  60.36 
 
 		 223 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  60.73 
 
 		 224 aa  281  8.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0808  radical SAM domain-containing protein  58.56 
 
 		 223 aa  280  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  56.76 
 
 		 222 aa  279  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  59.91 
 
 		 223 aa  279  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3229  radical SAM domain-containing protein  58.56 
 
 		 223 aa  278  5e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000624181  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  56.76 
 
 		 223 aa  277  9e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0580  hypothetical protein  59.55 
 
 		 226 aa  275  3e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.894879  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  56.56 
 
 		 224 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  56.82 
 
 		 226 aa  270  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  57.21 
 
 		 223 aa  268  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0977  radical SAM domain-containing protein  57.21 
 
 		 223 aa  268  5e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3444  radical SAM domain-containing protein  57.21 
 
 		 223 aa  268  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2960  radical SAM family protein  56.95 
 
 		 248 aa  268  5e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003398  queuosine Biosynthesis QueE Radical SAM  57.27 
 
 		 226 aa  261  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.593414  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  57.78 
 
 		 246 aa  257  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02385  hypothetical protein  56.28 
 
 		 216 aa  250  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0220  hypothetical protein  50 
 
 		 223 aa  241  9e-63  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6259  Radical SAM domain protein  47.01 
 
 		 230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7690  hypothetical protein  47.79 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  37.67 
 
 		 210 aa  124  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  37.39 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  35.45 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  36.04 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  32.89 
 
 		 205 aa  114  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  32.44 
 
 		 205 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06800  hypothetical protein  34.39 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0516243  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0659  Radical SAM domain protein  33.63 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.917391  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  35.11 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  34.38 
 
 		 209 aa  108  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  34.67 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  33.64 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  33.04 
 
 		 195 aa  104  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  35 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1300  hypothetical protein  34.35 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.946675 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  35.59 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  33.04 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  31.06 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18811  putative organic radical activating protein  32.64 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.409827  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  29.65 
 
 		 192 aa  98.2  8e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  34.21 
 
 		 210 aa  98.2  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18811  putative organic radical activating protein  33.75 
 
 		 223 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.533025  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19001  putative organic radical activating protein  32.64 
 
 		 225 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.843472  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3115  organic radical activating enzyme-like protein  32.74 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.369286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1198  hypothetical protein  33.63 
 
 		 210 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.949639 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2504  organic radical activating enzymes-like  33.04 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3118  organic radical activating enzymes-like protein  33.04 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3134  organic radical activating enzyme-like protein  33.04 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.260686 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2285  hypothetical protein  32.3 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  29.92 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0153  hypothetical protein  32.3 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0357  GntS  32.3 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6469  organic radical activating-like protein  33.48 
 
 		 210 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0162  organic radical activating protein  32.3 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2794  hypothetical protein  32.3 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1382  hypothetical protein  34.2 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.41745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2364  hypothetical protein  32.3 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0172  hypothetical protein  32.3 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0044  radical SAM domain-containing protein  33.92 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3056  organic radical activating enzyme-like protein  33.48 
 
 		 210 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3173  organic radical activating enzyme-like protein  33.48 
 
 		 210 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.655462  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18221  putative organic radical activating protein  31.69 
 
 		 226 aa  95.5  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0138  hypothetical protein  31.22 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620978  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1449  hypothetical protein  34.21 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0922  hypothetical protein  31.65 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1418  radical SAM domain-containing protein  32.92 
 
 		 217 aa  92.8  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0526  hypothetical protein  32.16 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313091  normal  0.440749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>